25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3522 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3522  hypothetical protein  100 
 
 		 67 aa  143  8.000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.252753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0972  hypothetical protein  71.64 
 
 		 67 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0084  hypothetical protein  76.12 
 
 		 67 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2632  hypothetical protein  71.64 
 
 		 67 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2872  hypothetical protein  72.31 
 
 		 67 aa  108  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0814  hypothetical protein  66.67 
 
 		 68 aa  100  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.616088 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3300  hypothetical protein  67.65 
 
 		 68 aa  99.4  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0880  hypothetical protein  67.65 
 
 		 68 aa  99.4  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0825  hypothetical protein  67.65 
 
 		 68 aa  99.4  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0565  hypothetical protein  60.94 
 
 		 68 aa  97.4  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0777478 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3267  hypothetical protein  64.71 
 
 		 68 aa  93.2  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4355  hypothetical protein  60.61 
 
 		 71 aa  85.5  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1972  hypothetical protein  55.22 
 
 		 67 aa  85.9  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132561 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4218  hypothetical protein  61.54 
 
 		 68 aa  84.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.093569 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3894  hypothetical protein  61.54 
 
 		 68 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.796989  normal  0.21889 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0302  domain of unknown function DUF1737  52.94 
 
 		 68 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.196664 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3025  hypothetical protein  56.92 
 
 		 68 aa  76.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347057  normal  0.478414 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2632  hypothetical protein  44.9 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242666  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5839  hypothetical protein  50 
 
 		 68 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5021  hypothetical protein  50 
 
 		 68 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.111857  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4340  hypothetical protein  54.29 
 
 		 66 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.945633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1418  domain of unknown function DUF1737  40.38 
 
 		 62 aa  44.7  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0511  domain of unknown function DUF1737  42 
 
 		 79 aa  44.3  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00417633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3643  domain of unknown function DUF1737  43.75 
 
 		 92 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0958  hypothetical protein  43.75 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.42475  normal  0.045384 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>