12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3425 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3425  hypothetical protein  100 
 
 		 313 aa  649    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.143139  normal  0.528642 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00204  hypothetical protein  44.44 
 
 		 310 aa  253  4.0000000000000004e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1303  hypothetical protein  38.56 
 
 		 312 aa  246  4e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.805165  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2236  hypothetical protein  35.14 
 
 		 325 aa  225  6e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2310  hypothetical protein  39.17 
 
 		 324 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.108131 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09383  hypothetical protein  34.89 
 
 		 290 aa  189  5e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.474977  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1138  hypothetical protein  31.58 
 
 		 324 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1425  hypothetical protein  27.44 
 
 		 335 aa  96.3  5e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0715  hypothetical protein  25 
 
 		 321 aa  79.7  0.00000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.821886  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0589  hypothetical protein  23.86 
 
 		 347 aa  55.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.611508 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1516  hypothetical protein  23.81 
 
 		 343 aa  45.4  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.069659  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4673  methicillin resistance protein  28 
 
 		 383 aa  42.7  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>