45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3166 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3166  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  678    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1770  hypothetical protein  78.38 
 
 		 333 aa  546  1e-154  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0416  hypothetical protein  78.68 
 
 		 333 aa  546  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2482  hypothetical protein  77.78 
 
 		 333 aa  537  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1206  protein of unknown function DUF1611  76.44 
 
 		 331 aa  534  1e-151  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.356367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0366  hypothetical protein  74.77 
 
 		 333 aa  527  1e-149  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0034  hypothetical protein  69.28 
 
 		 332 aa  485  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1220  protein of unknown function DUF1611  60.49 
 
 		 330 aa  416  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2786  protein of unknown function DUF1611  59.7 
 
 		 329 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4657  hypothetical protein  53.47 
 
 		 337 aa  360  1e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2557  hypothetical protein  56.36 
 
 		 335 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1484  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4476  protein of unknown function DUF1611  51.81 
 
 		 340 aa  353  2e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4542  hypothetical protein  52.11 
 
 		 340 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.398083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2676  hypothetical protein  52.87 
 
 		 336 aa  347  2e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.462333  normal  0.475395 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2903  protein of unknown function DUF1611  52.57 
 
 		 336 aa  345  5e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.141411 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2798  protein of unknown function DUF1611  52.87 
 
 		 336 aa  344  2e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3257  hypothetical protein  47.88 
 
 		 359 aa  335  5e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.161607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3968  protein of unknown function DUF1611  50.93 
 
 		 335 aa  330  2e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0847793  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1462  hypothetical protein  48.9 
 
 		 346 aa  327  1.0000000000000001e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0204992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1127  hypothetical protein  51.68 
 
 		 340 aa  326  4.0000000000000003e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160448 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0149  protein of unknown function DUF1611  50.62 
 
 		 335 aa  322  7e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2789  hypothetical protein  45.76 
 
 		 333 aa  316  3e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06557  hypothetical protein  46.08 
 
 		 340 aa  313  1.9999999999999998e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000678  EBNA-1 nuclear protein  46.69 
 
 		 334 aa  313  3.9999999999999997e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1819  hypothetical protein  50 
 
 		 348 aa  305  6e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0205  protein of unknown function DUF1611  38.81 
 
 		 337 aa  192  6e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1378  protein of unknown function DUF1611  39.21 
 
 		 337 aa  177  3e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.421477 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1623  protein of unknown function DUF1611  39.71 
 
 		 363 aa  172  5.999999999999999e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.631955 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4341  protein of unknown function DUF1611  35.67 
 
 		 343 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0593  protein of unknown function DUF1611  34.75 
 
 		 340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1405  hypothetical protein  38.18 
 
 		 348 aa  164  2.0000000000000002e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3511  hypothetical protein  38.38 
 
 		 348 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.350857 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4403  protein of unknown function DUF1611  35.33 
 
 		 343 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.654147  hitchhiker  0.000982381 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2779  hypothetical protein  36.49 
 
 		 348 aa  156  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2372  hypothetical protein  35.88 
 
 		 349 aa  155  8e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0792  hypothetical protein  32.08 
 
 		 365 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3589  protein of unknown function DUF1611  34.86 
 
 		 348 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0838311 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1538  hypothetical protein  32.53 
 
 		 353 aa  153  5e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2290  protein of unknown function DUF1611  33.96 
 
 		 341 aa  152  5.9999999999999996e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0130  hypothetical protein  36.44 
 
 		 338 aa  149  6e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.550989  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0132  hypothetical protein  36.44 
 
 		 338 aa  149  7e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0852  hypothetical protein  36.1 
 
 		 360 aa  140  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.98076  normal  0.809264 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2299  hypothetical protein  29.59 
 
 		 392 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1935  protein of unknown function DUF1611  28.42 
 
 		 354 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.614904  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1833  hypothetical protein  27.7 
 
 		 371 aa  86.7  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>