18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1975 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1975  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  215  2e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.152581 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1988  hypothetical protein  58.25 
 
 		 114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.480942  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0698  hypothetical protein  57.28 
 
 		 114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2022  hypothetical protein  29.13 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000128299  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0621  hypothetical protein  28.85 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1547  hypothetical protein  33.33 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0712336  normal  0.299034 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0363  hypothetical protein  27.18 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0386  hypothetical protein  27.18 
 
 		 123 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0360  hypothetical protein  27.18 
 
 		 123 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0372  hypothetical protein  27.18 
 
 		 123 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0357  hypothetical protein  29.29 
 
 		 129 aa  44.7  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0429  hypothetical protein  27.18 
 
 		 123 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3794  hypothetical protein  26.04 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0367  hypothetical protein  27.18 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2138  hypothetical protein  25.51 
 
 		 131 aa  41.2  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0167  hypothetical protein  32.31 
 
 		 166 aa  41.6  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0374  hypothetical protein  26.21 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2030  hypothetical protein  28.12 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000204387  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>