197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1675 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1675  protein of unknown function DUF403  100 
 
 
315 aa  649    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1013  protein of unknown function DUF403  65.47 
 
 
312 aa  437  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0471288  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3034  hypothetical protein  62.01 
 
 
312 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3100  hypothetical protein  44.52 
 
 
312 aa  269  5e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.154956  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2057  hypothetical protein  43.27 
 
 
322 aa  260  2e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.647616  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2906  hypothetical protein  42.21 
 
 
328 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2523  protein of unknown function DUF403  42.21 
 
 
328 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0989  hypothetical protein  42.45 
 
 
314 aa  251  1e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0774  hypothetical protein  39.42 
 
 
311 aa  248  1e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0307  hypothetical protein  40.91 
 
 
310 aa  233  2.0000000000000002e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.435724  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0398  hypothetical protein  39.35 
 
 
332 aa  219  3.9999999999999997e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2637  hypothetical protein  38.05 
 
 
331 aa  204  2e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.37252  normal  0.66457 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2265  hypothetical protein  39.09 
 
 
327 aa  202  5e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0396  protein of unknown function DUF403  35 
 
 
320 aa  194  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.995526 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1492  protein of unknown function DUF403  35.33 
 
 
335 aa  193  3e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0309521  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1033  hypothetical protein  35.03 
 
 
318 aa  191  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.403724 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11431  hypothetical protein  35.56 
 
 
313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11441  hypothetical protein  35.56 
 
 
313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4414  protein of unknown function DUF403  34 
 
 
334 aa  188  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4430  protein of unknown function DUF403  34.18 
 
 
321 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1050  hypothetical protein  35.56 
 
 
313 aa  186  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15701  hypothetical protein  35.58 
 
 
324 aa  185  9e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.743902  normal  0.307472 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4767  protein of unknown function DUF403  33.86 
 
 
329 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4494  protein of unknown function DUF403  33.86 
 
 
321 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0732  hypothetical protein  36.6 
 
 
324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.109994  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3593  protein of unknown function DUF403  32.49 
 
 
324 aa  182  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0544052  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2473  hypothetical protein  33.54 
 
 
319 aa  160  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.353765  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3243  protein of unknown function DUF403  33.68 
 
 
313 aa  159  5e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.622623  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1428  hypothetical protein  31.65 
 
 
325 aa  158  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1184  hypothetical protein  31.72 
 
 
357 aa  157  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.965632  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3402  protein of unknown function DUF403  32.11 
 
 
318 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.454494  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1743  hypothetical protein  30.45 
 
 
356 aa  157  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.331715  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1750  protein of unknown function DUF403  30.65 
 
 
357 aa  157  3e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.594588  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1122  hypothetical protein  32.34 
 
 
316 aa  156  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.225451  normal  0.376208 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0732  protein of unknown function DUF403  31.53 
 
 
355 aa  155  6e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0405  hypothetical protein  31.79 
 
 
319 aa  154  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.171087 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2549  hypothetical protein  34.08 
 
 
318 aa  155  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0459959  normal  0.464961 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1402  hypothetical protein  30.22 
 
 
360 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.236553 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0965  protein of unknown function DUF403  31.35 
 
 
316 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0328086 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1084  hypothetical protein  33.11 
 
 
317 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1061  protein of unknown function DUF403  31.35 
 
 
316 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.823298  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2677  hypothetical protein  30.06 
 
 
313 aa  151  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.174455  normal  0.967196 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2606  hypothetical protein  33.13 
 
 
319 aa  152  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.604318 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1207  hypothetical protein  33.12 
 
 
320 aa  151  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1354  hypothetical protein  31.83 
 
 
324 aa  151  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.531652  hitchhiker  0.00962099 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5078  hypothetical protein  31.35 
 
 
322 aa  149  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0605764 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3156  hypothetical protein  33.54 
 
 
320 aa  149  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.144051  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3875  protein of unknown function DUF403  35.57 
 
 
315 aa  149  9e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1064  protein of unknown function DUF403  29.71 
 
 
354 aa  146  4.0000000000000006e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.11735 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1048  hypothetical protein  32.79 
 
 
317 aa  146  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0181882  normal  0.326786 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0392  hypothetical protein  30.89 
 
 
322 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2115  hypothetical protein  31.19 
 
 
313 aa  144  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.107173  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0936  protein of unknown function DUF403  31.72 
 
 
322 aa  144  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.518701  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1021  hypothetical protein  31.72 
 
 
322 aa  144  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.434907  normal  0.790482 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3020  hypothetical protein  32.12 
 
 
315 aa  141  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00142607  normal  0.658817 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2244  protein of unknown function DUF403  29.49 
 
 
333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0070  hypothetical protein  32.46 
 
 
308 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0505568  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1814  hypothetical protein  29.9 
 
 
313 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0331912  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3525  hypothetical protein  29.65 
 
 
313 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2902  protein of unknown function DUF403  29.68 
 
 
313 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0224401  normal  0.852232 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4481  hypothetical protein  28.21 
 
 
313 aa  136  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2049  protein of unknown function DUF403  31.75 
 
 
331 aa  135  7.000000000000001e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.715011 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3012  hypothetical protein  30.41 
 
 
316 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.256372  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3436  hypothetical protein  28.08 
 
 
321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3389  hypothetical protein  28.12 
 
 
345 aa  132  6e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3167  protein of unknown function DUF403  28.85 
 
 
313 aa  132  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.78656  normal  0.654183 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37680  hypothetical protein  31.27 
 
 
316 aa  132  6.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.454306  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1311  protein of unknown function DUF403  32.48 
 
 
333 aa  132  6.999999999999999e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.754495  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3760  hypothetical protein  30 
 
 
319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.198455  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3319  hypothetical protein  30 
 
 
321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.846078  normal  0.720686 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0646  protein of unknown function DUF403  27.88 
 
 
313 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2255  protein of unknown function DUF403  30.77 
 
 
317 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000569022 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2053  hypothetical protein  29.05 
 
 
343 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0764  hypothetical protein  30.79 
 
 
316 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.5401  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2239  hypothetical protein  31.33 
 
 
314 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.580599  normal  0.384966 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0766  hypothetical protein  29.05 
 
 
313 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0675  hypothetical protein  29.05 
 
 
313 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0772  hypothetical protein  29.05 
 
 
313 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.715045  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1065  hypothetical protein  29.05 
 
 
313 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2040  hypothetical protein  29.05 
 
 
313 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0798659  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4444  protein of unknown function DUF403  30.79 
 
 
316 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1921  hypothetical protein  30.86 
 
 
313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4512  hypothetical protein  28.98 
 
 
316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601493  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4003  hypothetical protein  28.87 
 
 
313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0922511  normal  0.156692 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1780  hypothetical protein  28.72 
 
 
313 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3107  hypothetical protein  29.94 
 
 
316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3158  hypothetical protein  31.27 
 
 
314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.188108  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2204  protein of unknown function DUF403  31.99 
 
 
310 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.878183  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2774  hypothetical protein  28.38 
 
 
315 aa  127  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1941  hypothetical protein  29.14 
 
 
313 aa  127  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.572678 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2687  hypothetical protein  29.01 
 
 
316 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0355776  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3066  hypothetical protein  29.01 
 
 
316 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.417228  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3520  hypothetical protein  28.18 
 
 
313 aa  125  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17360  hypothetical protein  32.57 
 
 
304 aa  124  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0522809  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1870  hypothetical protein  29.63 
 
 
319 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.088676  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2165  protein of unknown function DUF403  30.07 
 
 
314 aa  124  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1736  hypothetical protein  30.96 
 
 
316 aa  124  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1935  hypothetical protein  28.18 
 
 
313 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171961  normal  0.693971 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4572  protein of unknown function DUF403  32.42 
 
 
324 aa  124  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3414  hypothetical protein  28.18 
 
 
313 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.217438  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>