21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0516 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0516  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
360 aa  728    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.869562  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1606  glycosyl transferase, group 1  62.21 
 
 
357 aa  405  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.444102  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2123  glycosyl transferase, group 1  48.59 
 
 
350 aa  300  3e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.887263  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3631  glycosyl transferase, group 1  45.94 
 
 
363 aa  291  8e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.190155  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2229  hypothetical protein  40.28 
 
 
353 aa  241  1e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00330354 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2466  glycosyl transferase group 1  40.38 
 
 
390 aa  236  6e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0984  glycosyl transferase group 1  34.64 
 
 
364 aa  182  7e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1759  glycosyltransferase-like protein  37.35 
 
 
378 aa  182  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.123674 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2035  glycosyltransferase  35.29 
 
 
390 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2458  glycosyltransferase-like protein  36.79 
 
 
378 aa  173  5e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2856  glycosyltransferase-like protein  32.54 
 
 
376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1403  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
393 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.944674  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1530  glycosyl transferase, group 1  36.17 
 
 
380 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1696  glycosyl transferase group 1  35.87 
 
 
366 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2289  glycosyl transferase group 1  33.84 
 
 
380 aa  134  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00582583 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0157  hypothetical protein  31.48 
 
 
357 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6871  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
378 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0276  glycosyl transferase group 1  28.97 
 
 
342 aa  45.1  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.949437  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1744  glycosyl transferase, group 1  27.46 
 
 
343 aa  43.9  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3596  glycosyl transferase group 1  32.19 
 
 
393 aa  43.5  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1523  glycosyl transferase, group 1  23.65 
 
 
413 aa  42.7  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.429358 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>