21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1351 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1351  rod shape-determining protein MreD  100 
 
 		 172 aa  331  4e-90  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1541  rod shape-determining protein MreD  26.39 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.110151  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1639  hypothetical protein  44.44 
 
 		 167 aa  53.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000014307  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2546  hypothetical protein  40 
 
 		 166 aa  52.4  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1464  hypothetical protein  41.18 
 
 		 164 aa  52  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0710  rod shape-determining protein MreD  40.91 
 
 		 164 aa  52  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0090  hypothetical protein  35.71 
 
 		 176 aa  48.9  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7283  rod shape-determining protein MreD  35.14 
 
 		 193 aa  48.5  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3337  rod shape-determining protein MreD  44.12 
 
 		 166 aa  48.5  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00122774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0672  rod shape-determining protein MreD  33.8 
 
 		 186 aa  47.8  0.00008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.903722 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0768  rod shape-determining protein MreD  26.71 
 
 		 167 aa  47.4  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0581991  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7280  hypothetical protein  40.32 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.283498 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1538  rod shape-determining protein MreD  31.88 
 
 		 163 aa  45.8  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.207887  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5267  putative rod shape-determining protein MreD; putative membrane protein  46.3 
 
 		 178 aa  45.1  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.396578 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1213  rod shape-determining protein  29.06 
 
 		 180 aa  44.7  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2660  rod shape-determining protein MreD  31.52 
 
 		 193 aa  44.3  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.381891 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2561  rod shape-determining protein MreD  33.78 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0143656  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4349  rod shape-determining protein MreD  33.75 
 
 		 169 aa  43.9  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.668781  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1070  rod shape-determining protein MreD  30.43 
 
 		 180 aa  43.5  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2220  rod shape-determining protein MreD  38.46 
 
 		 166 aa  42  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1259  rod shape-determining protein MreD  25 
 
 		 175 aa  41.2  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00973114  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>