21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1280 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1280  hypothetical protein  100 
 
 
233 aa  475  1e-133  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1988  hypothetical protein  55.11 
 
 
229 aa  262  3e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0764  hypothetical protein  48.66 
 
 
222 aa  239  2.9999999999999997e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0471664  normal  0.441546 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1455  hypothetical protein  46.67 
 
 
224 aa  229  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000773968  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf079  conserved hypothetical protein, possible DNA alkylation repair enzyme  50.23 
 
 
246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.389712  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1460  hypothetical protein  45.5 
 
 
230 aa  192  3e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2175  hypothetical protein  34.5 
 
 
227 aa  141  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.094597  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0119  hypothetical protein  36.84 
 
 
235 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0820  hypothetical protein  34.47 
 
 
270 aa  121  9e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1508  hypothetical protein  30.63 
 
 
223 aa  94.4  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00485702  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0298  hypothetical protein  21.23 
 
 
263 aa  48.9  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0012  hypothetical protein  24.32 
 
 
241 aa  46.2  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5052  hypothetical protein  24.15 
 
 
237 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5045  hypothetical protein  25 
 
 
237 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1562  hypothetical protein  26.86 
 
 
240 aa  43.1  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0968542  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5145  hypothetical protein  24.53 
 
 
237 aa  42.4  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4623  hypothetical protein  24.53 
 
 
237 aa  42.4  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4783  hypothetical protein  24.53 
 
 
237 aa  42.4  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5057  hypothetical protein  24.53 
 
 
237 aa  42  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5024  hypothetical protein  24.53 
 
 
237 aa  42  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1238  DNA alkylation repair enzyme  22.5 
 
 
250 aa  41.6  0.01  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>