More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0625 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
256 aa  523  1e-148  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1178  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  43.87 
 
 
262 aa  254  1.0000000000000001e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.240461  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0797  ferrichrome ABC transporter ATP-binding protein  48.32 
 
 
260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.274021  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0810  putative ferrichrome ABC transporter, ATP-binding protein  47.9 
 
 
260 aa  252  3e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.024008  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0489  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  44.53 
 
 
271 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  43.57 
 
 
278 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00555  iron-enterobactin transporter subunit  44.53 
 
 
271 aa  251  6e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3038  ABC transporter related protein  44.53 
 
 
271 aa  251  6e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.751545  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  44.53 
 
 
271 aa  251  6e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3056  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  44.53 
 
 
271 aa  251  6e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  44.53 
 
 
271 aa  251  6e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00544  hypothetical protein  44.53 
 
 
271 aa  251  6e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0639  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  44.53 
 
 
271 aa  251  6e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0333  ABC transporter related  44.31 
 
 
282 aa  251  7e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1120  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  44.27 
 
 
266 aa  251  1e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.721216  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0643  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  44.14 
 
 
264 aa  249  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3084  ABC transporter related  44.66 
 
 
269 aa  250  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.41824  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0686  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  44.14 
 
 
264 aa  249  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.926109 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0629  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  44.14 
 
 
264 aa  250  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.781197  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0748  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  44.14 
 
 
264 aa  250  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1737  ABC transporter related  41.73 
 
 
284 aa  249  3e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0324533  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0702  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  44.14 
 
 
264 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3037  ABC transporter related  44.27 
 
 
269 aa  248  7e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0672  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  44.14 
 
 
271 aa  247  1e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2417  ABC transporter-like protein  47.04 
 
 
274 aa  246  2e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  44 
 
 
268 aa  244  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4042  ABC transporter related protein  43.6 
 
 
257 aa  243  1.9999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7287  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron (III) dicitrate)  43.95 
 
 
264 aa  243  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2406  ABC transporter-related protein  43.3 
 
 
271 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000284506  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0416  ABC transporter related  44.27 
 
 
284 aa  243  3e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7988  ABC transporter related protein  44.66 
 
 
260 aa  243  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.34701  normal  0.255367 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2320  ABC transporter related protein  41.11 
 
 
277 aa  242  3.9999999999999997e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2583  ABC transporter related protein  41.02 
 
 
293 aa  241  6e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3932  ABC transporter related  41.73 
 
 
271 aa  241  6e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1814  ABC transporter related  44.18 
 
 
275 aa  241  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3426  ABC transporter-related protein  41.9 
 
 
267 aa  240  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.175923 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2702  ABC transporter related  40.62 
 
 
290 aa  240  2e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2416  ABC transporter related  43.15 
 
 
273 aa  240  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.118562 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22100  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  42.58 
 
 
273 aa  239  2.9999999999999997e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0870397 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0750  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.91 
 
 
272 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4448  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.91 
 
 
272 aa  238  8e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1239  ABC transporter related  41.8 
 
 
292 aa  238  8e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.469823  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4214  ABC transporter related  43.31 
 
 
272 aa  238  8e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4263  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  43.31 
 
 
272 aa  237  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4111  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  43.31 
 
 
272 aa  238  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4447  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  43.31 
 
 
272 aa  237  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4595  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  43.31 
 
 
272 aa  237  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4486  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.52 
 
 
272 aa  237  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5053  ABC transporter related  41.63 
 
 
271 aa  237  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3732  ABC transporter related  43.31 
 
 
270 aa  237  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4100  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.91 
 
 
272 aa  236  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2824  ABC transporter related  41.83 
 
 
278 aa  236  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0685  ABC transporter related  45.15 
 
 
265 aa  236  3e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4500  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.91 
 
 
272 aa  236  3e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0670  ABC transporter related  45.15 
 
 
265 aa  236  3e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0540  ABC transporter related  41.18 
 
 
296 aa  235  4e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139778  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26520  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  43.31 
 
 
625 aa  236  4e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3639  ABC transporter related  42.19 
 
 
269 aa  235  6e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.395378  normal  0.0643524 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0136  ABC transporter related  42.75 
 
 
272 aa  235  6e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0466  ABC transporter related  43.55 
 
 
286 aa  235  6e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0306  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  44.58 
 
 
265 aa  234  9e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2442  ABC transporter related  42.86 
 
 
316 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0120547 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3768  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40.61 
 
 
273 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19110  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  40.71 
 
 
271 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0967158 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001072  ferrichrome ABC transporter (ATP binding subunit) PvuE  39.92 
 
 
254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2816  ABC transporter related protein  41.9 
 
 
263 aa  232  4.0000000000000004e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0308  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, ATP-binding protein  42.29 
 
 
279 aa  231  6e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3149  ABC transporter related  41.41 
 
 
271 aa  231  7.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0281771  hitchhiker  0.00000000506205 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5174  ABC transporter related  42.92 
 
 
270 aa  231  9e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.32 
 
 
273 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000209969 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3756  ABC transporter related protein  39.77 
 
 
274 aa  231  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0336  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems ATPase components  39.84 
 
 
273 aa  231  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3503  ABC transporter related  41.32 
 
 
273 aa  231  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3834  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40.23 
 
 
273 aa  230  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.860088  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02590  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  41.25 
 
 
302 aa  230  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.225702  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4682  ferric enterobactin transport ATP-binding protein FepC  40.62 
 
 
273 aa  229  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.207042  hitchhiker  1.64862e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3784  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.32 
 
 
273 aa  230  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0409851  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1465  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40.23 
 
 
273 aa  229  3e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000310402 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0655  ferric enterobactin transport ATP-binding protein FepC  40.62 
 
 
273 aa  229  4e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00198512  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2759  ABC transporter-related protein  46.25 
 
 
263 aa  229  5e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.078515  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3480  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40.91 
 
 
273 aa  228  6e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3492  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40.91 
 
 
273 aa  228  6e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3299  ABC transporter related  40.23 
 
 
265 aa  228  6e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.971669  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0686  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40.71 
 
 
273 aa  228  7e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3732  ABC transporter related protein  40.08 
 
 
276 aa  228  7e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2593  ABC transporter  41.9 
 
 
263 aa  228  8e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.295481  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0532  ABC transporter related  40.62 
 
 
273 aa  228  8e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.969378  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5746  ABC transporter related  39.84 
 
 
264 aa  228  9e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1621  ABC transporter-like protein  40.64 
 
 
266 aa  228  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.76125  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0584  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  40.71 
 
 
273 aa  227  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3580  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  40.5 
 
 
273 aa  226  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.961054  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0528  iron(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  40.71 
 
 
273 aa  227  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.37672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0528  iron(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  40.71 
 
 
273 aa  227  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0618  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  40.71 
 
 
273 aa  227  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3864  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  40.5 
 
 
273 aa  226  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40.71 
 
 
273 aa  227  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0014346  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2061  ABC transporter related  40.47 
 
 
277 aa  226  3e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.948125 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0214  ferrichrome ABC transporter  44.63 
 
 
259 aa  226  3e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5334  ABC transporter related protein  39.84 
 
 
285 aa  226  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5447  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.25 
 
 
270 aa  225  4e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.753542  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>