179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0479 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0893  hydroxylamine reductase  61.62 
 
 		 546 aa  686    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0479  hydroxylamine reductase  100 
 
 		 540 aa  1109    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1669  hydroxylamine reductase  58.55 
 
 		 540 aa  643    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.100106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1978  hydroxylamine reductase  59.11 
 
 		 542 aa  645    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.881596  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2909  hydroxylamine reductase  62.71 
 
 		 547 aa  704    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1120  hydroxylamine reductase  63.97 
 
 		 568 aa  754    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.170872  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2587  hydroxylamine reductase  62.52 
 
 		 547 aa  704    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000431874  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0036  hydroxylamine reductase  62.78 
 
 		 542 aa  696    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1599  hybrid cluster protein  64.14 
 
 		 549 aa  714    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000102791  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4539  hydroxylamine reductase  59.05 
 
 		 549 aa  664    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0970  hydroxylamine reductase  60.55 
 
 		 591 aa  647    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.164641  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1829  hydroxylamine reductase  63.03 
 
 		 545 aa  724    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0149  hydroxylamine reductase  58.92 
 
 		 542 aa  646    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00268758  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0219  hydroxylamine reductase  60 
 
 		 538 aa  655    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3948  hybrid cluster protein  60.14 
 
 		 551 aa  668    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0164  hydroxylamine reductase  60.48 
 
 		 546 aa  648    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.930451  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2846  hydroxylamine reductase  64.12 
 
 		 621 aa  728    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0957  hydroxylamine reductase  60.58 
 
 		 547 aa  665    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1490  hydroxylamine reductase  57.73 
 
 		 540 aa  625  1e-178  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000660036  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0977  hydroxylamine reductase  55.66 
 
 		 555 aa  623  1e-177  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.349617 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1660  hydroxylamine reductase  54.61 
 
 		 562 aa  615  1e-175  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0749  hydroxylamine reductase  58.29 
 
 		 543 aa  616  1e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000113817  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0512  hydroxylamine reductase  57.62 
 
 		 540 aa  613  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.96139  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1595  hydroxylamine reductase  57.38 
 
 		 543 aa  611  9.999999999999999e-175  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.333402  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0506  hydroxylamine reductase  57.62 
 
 		 542 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.775368 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1125  hydroxylamine reductase  57.81 
 
 		 542 aa  600  1e-170  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000097703  normal  0.234741 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1919  hydroxylamine reductase  56.93 
 
 		 553 aa  601  1e-170  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.877615  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2875  hydroxylamine reductase  56.75 
 
 		 548 aa  595  1e-169  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0115588  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18290  hydroxylamine reductase  55.84 
 
 		 555 aa  593  1e-168  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000343984  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1053  hydroxylamine reductase  53.76 
 
 		 539 aa  590  1e-167  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0754  hydroxylamine reductase  55.01 
 
 		 552 aa  580  1e-164  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0466  hydroxylamine reductase  55.68 
 
 		 542 aa  577  1.0000000000000001e-163  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1163  hydroxylamine reductase  53.96 
 
 		 543 aa  566  1e-160  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1634  hydroxylamine reductase  53.06 
 
 		 538 aa  541  1e-153  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.228305  normal  0.622946 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2189  hydroxylamine reductase  51.01 
 
 		 538 aa  536  1e-151  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00125687  normal  0.781035 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2242  hydroxylamine reductase  50.93 
 
 		 541 aa  525  1e-148  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.675401  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1173  hydroxylamine reductase  46.57 
 
 		 549 aa  491  1e-137  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000032867  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1523  hydroxylamine reductase  51.39 
 
 		 526 aa  482  1e-135  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.53511  normal  0.352571 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1609  hydroxylamine reductase  44.67 
 
 		 542 aa  473  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.726092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0974  hydroxylamine reductase  46.3 
 
 		 546 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00100558  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1600  hydroxylamine reductase  45.04 
 
 		 542 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2834  hydroxylamine reductase  43.94 
 
 		 547 aa  464  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000787255  hitchhiker  0.00000000000275149 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0742  hydroxylamine reductase  45.72 
 
 		 531 aa  462  1e-129  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.483638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0663  hydroxylamine reductase  43.72 
 
 		 541 aa  464  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.430546  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2872  hydroxylamine reductase  43.32 
 
 		 553 aa  460  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000295577  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3702  hydroxylamine reductase  43.77 
 
 		 533 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.456407  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1201  hydroxylamine reductase  44.94 
 
 		 531 aa  460  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3576  hydroxylamine reductase  43.54 
 
 		 531 aa  460  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0596  hydroxylamine reductase  43.57 
 
 		 535 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1364  hydroxylamine reductase  44.19 
 
 		 549 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.453221  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0837  hydroxylamine reductase  43.37 
 
 		 550 aa  457  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00540032  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0988  hydroxylamine reductase  43.57 
 
 		 539 aa  456  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.160693 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0213  hydroxylamine reductase  42.86 
 
 		 533 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3228  hydroxylamine reductase  42.81 
 
 		 568 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0674  hydroxylamine reductase  42.11 
 
 		 548 aa  451  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.09718  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0585  hydroxylamine reductase  43.36 
 
 		 533 aa  449  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000760383  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1033  hydroxylamine reductase  43.17 
 
 		 568 aa  451  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1326  hydroxylamine reductase  48.8 
 
 		 545 aa  449  1e-125  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.611962  normal  0.884501 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2386  hydroxylamine reductase  42.78 
 
 		 566 aa  449  1e-125  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00790044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2647  hydroxylamine reductase  43.36 
 
 		 533 aa  449  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.654819  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3446  hydroxylamine reductase  41.35 
 
 		 542 aa  445  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000118604 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2941  hydroxylamine reductase  41.88 
 
 		 565 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1750  hybrid cluster protein  44.04 
 
 		 532 aa  443  1e-123  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.531638  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0406  hybrid cluster protein  42.7 
 
 		 554 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2641  hydroxylamine reductase  42.1 
 
 		 537 aa  442  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.897837  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0704  hydroxylamine reductase  42.36 
 
 		 537 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.308475 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28240  hydroxylamine reductase  41.79 
 
 		 525 aa  440  9.999999999999999e-123  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.230727 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2759  hydroxylamine reductase  42.21 
 
 		 549 aa  437  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2190  hydroxylamine reductase  41.61 
 
 		 526 aa  436  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.317395  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1168  hydroxylamine reductase  40.69 
 
 		 552 aa  435  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3609  hydroxylamine reductase  41.98 
 
 		 552 aa  430  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.918432  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2371  hydroxylamine reductase  40.9 
 
 		 550 aa  429  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0816  hydroxylamine reductase  40 
 
 		 545 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1055  hydroxylamine reductase  42.11 
 
 		 554 aa  432  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3038  hydroxylamine reductase  41.76 
 
 		 549 aa  428  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0895  hydroxylamine reductase  41.46 
 
 		 554 aa  427  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.62617 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1239  hydroxylamine reductase  41.58 
 
 		 549 aa  427  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000262121  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3125  hydroxylamine reductase  40.33 
 
 		 551 aa  428  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0845  hydroxylamine reductase  39.63 
 
 		 545 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1424  hydroxylamine reductase  42.88 
 
 		 522 aa  424  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.013462  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4165  hydroxylamine reductase  39.89 
 
 		 549 aa  425  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2832  hydroxylamine reductase  40.97 
 
 		 554 aa  419  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.310206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2914  hydroxylamine reductase  40.97 
 
 		 554 aa  420  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3011  hydroxylamine reductase  40.97 
 
 		 554 aa  420  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1174  hydroxylamine reductase  42.37 
 
 		 554 aa  421  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0529148  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1293  hydroxylamine reductase  41.71 
 
 		 554 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.86267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01080  hydroxylamine reductase  43.43 
 
 		 520 aa  418  9.999999999999999e-116  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.626709  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1363  hydroxylamine reductase  41.32 
 
 		 554 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2271  hydroxylamine reductase  40.54 
 
 		 550 aa  418  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.663099  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3097  hydroxylamine reductase  41.76 
 
 		 554 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0213297  normal  0.133055 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1069  hydroxylamine reductase  40.86 
 
 		 554 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1260  hydroxylamine reductase  41.58 
 
 		 554 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0137  hydroxylamine reductase  49.88 
 
 		 427 aa  414  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000271526  normal  0.86078 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4555  hydroxylamine reductase  41.39 
 
 		 555 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753041 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4090  hydroxylamine reductase  41.39 
 
 		 555 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1707  hydroxylamine reductase  40.43 
 
 		 550 aa  413  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1216  hydroxylamine reductase  41.4 
 
 		 554 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.453579  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1666  hydroxylamine reductase  40.14 
 
 		 565 aa  412  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.372025  normal  0.875893 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1591  hydroxylamine reductase  39.61 
 
 		 550 aa  414  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2701  hydroxylamine reductase  39.43 
 
 		 550 aa  412  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>