12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0229 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0229  ATPase family protein  100 
 
 		 626 aa  1255    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00298001  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1497  histidine kinase  41.38 
 
 		 621 aa  475  1e-132  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00383985  normal  0.0346949 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1178  hypothetical protein  40.74 
 
 		 629 aa  461  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0305032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3557  hypothetical protein  40.74 
 
 		 629 aa  461  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0398758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0935  hypothetical protein  20.64 
 
 		 646 aa  67.4  0.0000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.002395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3858  hypothetical protein  21.82 
 
 		 680 aa  59.7  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611595  normal  0.0467338 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52360  hypothetical protein  21.05 
 
 		 665 aa  50.4  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3861  hypothetical protein  27.1 
 
 		 700 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2309  hypothetical protein  26.83 
 
 		 666 aa  48.9  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.444355  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1436  ATPase, putative  37.06 
 
 		 672 aa  47.4  0.0008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.120762 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6973  hypothetical protein  30.51 
 
 		 683 aa  44.7  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000276494  normal  0.0405865 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0911  hypothetical protein  32.98 
 
 		 561 aa  44.3  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00412972  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>