22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0294 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0294  hypothetical protein  100 
 
 
243 aa  486  1e-136  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2399  hypothetical protein  86.78 
 
 
243 aa  433  1e-120  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26691  hypothetical protein  80.75 
 
 
278 aa  393  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01631  hypothetical protein  71.13 
 
 
245 aa  360  1e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.763625  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02201  hypothetical protein  67.49 
 
 
248 aa  359  3e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.348814  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1514  hypothetical protein  67.9 
 
 
248 aa  357  6e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01761  hypothetical protein  62.5 
 
 
242 aa  326  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.555031  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01651  hypothetical protein  61.25 
 
 
242 aa  316  2e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01671  hypothetical protein  60 
 
 
242 aa  311  4.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0150  hypothetical protein  60.67 
 
 
242 aa  310  2e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1979  membrane protein-like  64.13 
 
 
240 aa  293  1e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.460955  normal  0.262447 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1748  NnrU  62.21 
 
 
238 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.493483  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0460  NnrUfamily protein  61.36 
 
 
238 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3165  NnrUfamily protein  59.19 
 
 
240 aa  278  5e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0147  NnrUfamily protein  60.18 
 
 
238 aa  275  6e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2010  NnrU  59.19 
 
 
237 aa  273  1.0000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.491604 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0483  NnrUfamily protein  58.9 
 
 
257 aa  268  7e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.398718  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0470  NnrUfamily protein  58.9 
 
 
257 aa  267  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_16955  predicted protein  53.47 
 
 
231 aa  230  1e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0498  hypothetical protein  30.05 
 
 
226 aa  57  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3577  NnrU family protein  25.73 
 
 
234 aa  50.1  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0744833  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6222  denitrification regulatory protein  34.57 
 
 
237 aa  42  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.760958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>