22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2264 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2264  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  302  2.0000000000000002e-81  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.607727 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0416  hypothetical protein  82.19 
 
 
146 aa  229  8.000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03171  hypothetical protein  60.39 
 
 
168 aa  175  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.954075 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4021  WD40 domain protein beta Propeller  36.36 
 
 
171 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3979  hypothetical protein  36.36 
 
 
171 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4016  WD40 domain protein beta Propeller  29.8 
 
 
169 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.392857 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0522  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  29.68 
 
 
172 aa  67.4  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3466  WD40 domain protein beta Propeller  29.73 
 
 
190 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2651  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  29.73 
 
 
190 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.136026 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2755  WD40 domain-containing protein  27.08 
 
 
160 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3347  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  27.08 
 
 
160 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.52168  normal  0.409524 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0057  WD40 domain-containing protein  29.73 
 
 
175 aa  65.1  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2013  hypothetical protein  35.66 
 
 
175 aa  64.3  0.0000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.57132 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0056  WD40 domain-containing protein  29.75 
 
 
184 aa  60.5  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2014  hypothetical protein  34.59 
 
 
197 aa  60.1  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.598603 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0520  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  28.3 
 
 
186 aa  57.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.118512  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4138  WD40 domain protein beta Propeller  27.93 
 
 
197 aa  58.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4178  WD40 domain protein beta Propeller  27.93 
 
 
197 aa  58.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4015  WD40 domain protein beta Propeller  29.05 
 
 
174 aa  57.4  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.482104 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03181  hypothetical protein  36.36 
 
 
133 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.932316 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0417  hypothetical protein  34.38 
 
 
165 aa  47  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2263  hypothetical protein  35.29 
 
 
176 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.596766 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>