43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2057 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2057  3Fe-4S ferredoxin  100 
 
 
87 aa  182  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0381286  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0615  3Fe-4S ferredoxin  89.66 
 
 
92 aa  166  1e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04481  3Fe-4S ferredoxin  73.49 
 
 
126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16671  hypothetical protein  67.07 
 
 
119 aa  120  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.132285  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16791  hypothetical protein  67.07 
 
 
119 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16571  hypothetical protein  67.5 
 
 
121 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.262713  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1570  hypothetical protein  65.85 
 
 
119 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15971  ferredoxin  63.86 
 
 
128 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18761  hypothetical protein  62.2 
 
 
139 aa  113  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1007  ferredoxin  62.2 
 
 
139 aa  113  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2647  ferredoxin  64 
 
 
152 aa  110  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.668061  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2578  hypothetical protein  73.13 
 
 
108 aa  110  9e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.390984  normal  0.110309 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1749  ferredoxin  62.5 
 
 
130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.855381 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2579  ferredoxin  63.51 
 
 
151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.698297  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1897  ferredoxin  57.83 
 
 
137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5089  ferredoxin  66.2 
 
 
171 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.536243  normal  0.0695219 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0107  ferredoxin  62.67 
 
 
151 aa  108  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.8941  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0839  Ferredoxin-like protein  60.81 
 
 
156 aa  107  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00930022 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1921  Ferredoxin-like protein  56.63 
 
 
137 aa  107  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.207385  normal  0.934978 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_7660  predicted protein  49.38 
 
 
88 aa  84.3  4e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_9697  predicted protein  57.97 
 
 
73 aa  81.6  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.012492  normal  0.333418 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7956  predicted protein  50.72 
 
 
167 aa  66.2  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00346454  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3088  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  46.55 
 
 
62 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1186  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  46.55 
 
 
62 aa  54.7  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.627413  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0154  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.93 
 
 
63 aa  52  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.286313 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0773  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.6 
 
 
59 aa  50.1  0.000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.27215  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2933  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35 
 
 
64 aa  49.7  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1625  ferredoxin family protein, putative  36.21 
 
 
65 aa  50.1  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.216587  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45684  predicted protein  35.29 
 
 
561 aa  47  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1206  hypothetical protein  41.67 
 
 
317 aa  46.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0815  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  42.42 
 
 
186 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.783937 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1365  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  44.83 
 
 
63 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3170  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  42.11 
 
 
63 aa  45.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000199396  normal  0.668845 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0148  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  41.38 
 
 
62 aa  44.7  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3449  ferredoxin family protein, putative  37.93 
 
 
62 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2919  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  41.38 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.74825 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1093  ferredoxin family protein, putative  40.68 
 
 
64 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3169  ferredoxin family protein, putative  40.68 
 
 
64 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3187  ferredoxin family protein  39.29 
 
 
63 aa  40.8  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0900  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.66 
 
 
68 aa  40.8  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.800089  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3343  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.07 
 
 
63 aa  40.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000237293  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1814  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.33 
 
 
64 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2676  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.31 
 
 
64 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>