45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0852 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0852  hypothetical protein  100 
 
 
360 aa  702    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.98076  normal  0.809264 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4403  protein of unknown function DUF1611  50.58 
 
 
343 aa  339  5e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.654147  hitchhiker  0.000982381 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4341  protein of unknown function DUF1611  50 
 
 
343 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3589  protein of unknown function DUF1611  50.58 
 
 
348 aa  334  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0838311 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1405  hypothetical protein  48.27 
 
 
348 aa  318  1e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3511  hypothetical protein  49.86 
 
 
348 aa  311  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.350857 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2372  hypothetical protein  49.43 
 
 
349 aa  304  2.0000000000000002e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2779  hypothetical protein  41.6 
 
 
348 aa  196  6e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0593  protein of unknown function DUF1611  34.86 
 
 
340 aa  182  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0792  hypothetical protein  35.61 
 
 
365 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1378  protein of unknown function DUF1611  36.71 
 
 
337 aa  171  2e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.421477 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4476  protein of unknown function DUF1611  40.43 
 
 
340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0205  protein of unknown function DUF1611  30.09 
 
 
337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2290  protein of unknown function DUF1611  34.84 
 
 
341 aa  160  5e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1127  hypothetical protein  40.07 
 
 
340 aa  155  8e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00160448 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4542  hypothetical protein  39.05 
 
 
340 aa  155  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.398083  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4657  hypothetical protein  37.24 
 
 
337 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2789  hypothetical protein  35.74 
 
 
333 aa  152  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3968  protein of unknown function DUF1611  36.36 
 
 
335 aa  150  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0847793  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0366  hypothetical protein  36.96 
 
 
333 aa  150  4e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0149  protein of unknown function DUF1611  36.56 
 
 
335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06557  hypothetical protein  33.81 
 
 
340 aa  147  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2299  hypothetical protein  31.82 
 
 
392 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0034  hypothetical protein  38.93 
 
 
332 aa  146  7.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1623  protein of unknown function DUF1611  34.66 
 
 
363 aa  145  8.000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.631955 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1206  protein of unknown function DUF1611  35.99 
 
 
331 aa  145  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.356367  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2903  protein of unknown function DUF1611  37.45 
 
 
336 aa  142  9e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.141411 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2676  hypothetical protein  37.08 
 
 
336 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.462333  normal  0.475395 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1220  protein of unknown function DUF1611  36.55 
 
 
330 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3166  hypothetical protein  36.1 
 
 
333 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3257  hypothetical protein  34.53 
 
 
359 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.161607  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1462  hypothetical protein  37.94 
 
 
346 aa  140  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0204992  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000678  EBNA-1 nuclear protein  34.52 
 
 
334 aa  139  6e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2786  protein of unknown function DUF1611  37.41 
 
 
329 aa  139  7e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2798  protein of unknown function DUF1611  36.7 
 
 
336 aa  138  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1538  hypothetical protein  30.66 
 
 
353 aa  135  9e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2482  hypothetical protein  36.43 
 
 
333 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0130  hypothetical protein  34.27 
 
 
338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.550989  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0132  hypothetical protein  32.81 
 
 
338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1770  hypothetical protein  35.71 
 
 
333 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0416  hypothetical protein  35.36 
 
 
333 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1819  hypothetical protein  38.76 
 
 
348 aa  119  7.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1833  hypothetical protein  32.21 
 
 
371 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2557  hypothetical protein  35.13 
 
 
335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1484  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1935  protein of unknown function DUF1611  29.75 
 
 
354 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.614904  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>