17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0579 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0579  ribonuclease P protein component of ribozyme  100 
 
 
128 aa  252  1.0000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1785  ribonuclease P protein component of ribozyme  75.59 
 
 
128 aa  160  4.0000000000000004e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.391704  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12711  ribonuclease P protein component  43.2 
 
 
130 aa  111  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373516 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06111  ribonuclease P protein component  57.94 
 
 
128 aa  110  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.216071 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16581  ribonuclease P protein component  43.41 
 
 
128 aa  109  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0803  ribonuclease P protein component  43.41 
 
 
128 aa  106  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.530045  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13561  ribonuclease P protein component  34.13 
 
 
129 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.269036  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13771  ribonuclease P protein component  37.19 
 
 
128 aa  90.9  5e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.805452  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13851  ribonuclease P protein component  39.34 
 
 
128 aa  89.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.91647  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1285  ribonuclease P protein component  37.19 
 
 
128 aa  87.4  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.240066  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0685  ribonuclease P protein component  30.15 
 
 
140 aa  50.4  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  32.31 
 
 
131 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4708  ribonuclease P  26.83 
 
 
159 aa  44.3  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0896  ribonuclease P  27.78 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3433  ribonuclease P  29.32 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2778  ribonuclease P protein component  35.82 
 
 
86 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.07678  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03486  ribonuclease P protein component  35.9 
 
 
109 aa  40.4  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>