44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3623 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3623  glycine cleavage system regulatory protein-like protein  100 
 
 		 167 aa  336  9e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.640922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3434  glycine cleavage system regulatory protein-like protein  72.46 
 
 		 167 aa  258  2e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2884  glycine cleavage system regulatory protein-like protein  50.6 
 
 		 167 aa  171  5e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3675  glycine cleavage system regulatory protein-like protein  45.51 
 
 		 167 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3629  glycine cleavage system regulatory protein-like protein  40.36 
 
 		 167 aa  140  6e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.894872  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2546  hypothetical protein  40.85 
 
 		 175 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.761879 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02738  hypothetical protein  28.4 
 
 		 170 aa  72.4  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003104  glycine cleavage system regulatory protein  28.4 
 
 		 170 aa  70.9  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00303201  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05930  ACT domain-containing regulatory protein  23.78 
 
 		 172 aa  65.1  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000527553  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2229  amino acid-binding ACT domain protein  25.93 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0964148 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0481  ACT domain protein  22.42 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000098406  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0869  hypothetical protein  24.14 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00598997  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2002  amino acid-binding ACT domain-containing protein  25.15 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1273  amino acid-binding ACT domain protein  26.83 
 
 		 177 aa  61.6  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4699  amino acid-binding ACT  20.73 
 
 		 180 aa  60.8  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0000305264  normal  0.738616 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06310  ACT domain-containing protein  24.4 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183389  normal  0.204088 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03152  ACT domain protein  24.26 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4173  formyl transferase-like  30.82 
 
 		 385 aa  57  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0587  hypothetical protein  21.95 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000555119  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4094  amino acid-binding ACT domain-containing protein  23.31 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0332  amino acid-binding ACT domain-containing protein  24.55 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5182  ACT domain-containing protein  21.34 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248291  normal  0.129275 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3885  ACT domain-containing protein  23.46 
 
 		 165 aa  52.4  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1150  cellulose-binding family II protein  24.32 
 
 		 178 aa  52  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.768713 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1356  amino acid-binding ACT domain-containing protein  25.55 
 
 		 168 aa  51.6  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3321  amino acid-binding ACT  24.12 
 
 		 170 aa  51.2  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1500  amino acid-binding ACT domain-containing protein  26.03 
 
 		 166 aa  50.8  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000613254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1943  amino acid-binding ACT domain-containing protein  24.05 
 
 		 175 aa  49.7  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2746  amino acid-binding ACT domain-containing protein  21.92 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.989316  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2628  ACT domain-containing protein  27.86 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1722  ACT domain-containing protein  26.71 
 
 		 166 aa  48.5  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2735  ACT domain-containing protein  26.71 
 
 		 166 aa  48.1  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1433  amino acid-binding ACT domain-containing protein  25.34 
 
 		 166 aa  47.8  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2561  ACT domain-containing protein  27.14 
 
 		 166 aa  48.1  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1697  amino acid-binding ACT domain-containing protein  23.4 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.54674 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3169  amino acid-binding ACT domain-containing protein  22.86 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.765517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4845  amino acid-binding ACT domain-containing protein  23.42 
 
 		 172 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325717  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0357  ACT domain-containing protein  26.32 
 
 		 172 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000156308  normal  0.422502 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0385  amino acid-binding ACT domain-containing protein  26.32 
 
 		 172 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000250758  normal  0.230246 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0383  amino acid-binding ACT domain-containing protein  26.32 
 
 		 172 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000019763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1565  amino acid-binding ACT domain-containing protein  24.09 
 
 		 166 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2819  amino acid-binding ACT domain protein  24.09 
 
 		 166 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.198658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1537  amino acid-binding ACT domain-containing protein  24.09 
 
 		 166 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1532  amino acid-binding ACT domain-containing protein  24.09 
 
 		 166 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0236669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>