26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1262 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1262  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  223  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000230441 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1167  hypothetical protein  70.27 
 
 		 111 aa  138  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2914  hypothetical protein  48.65 
 
 		 114 aa  111  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1365  hypothetical protein  56.76 
 
 		 111 aa  110  6e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2830  hypothetical protein  56.76 
 
 		 111 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.616543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3009  hypothetical protein  56.76 
 
 		 111 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2912  hypothetical protein  57.66 
 
 		 111 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1176  hypothetical protein  54.95 
 
 		 111 aa  108  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2748  hypothetical protein  45.87 
 
 		 111 aa  107  6e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.344464  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3095  hypothetical protein  53.15 
 
 		 111 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.038994 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1295  hypothetical protein  53.15 
 
 		 111 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1218  hypothetical protein  53.15 
 
 		 111 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1262  hypothetical protein  53.15 
 
 		 111 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1057  hypothetical protein  45.28 
 
 		 112 aa  103  9e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.455459  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0897  hypothetical protein  41.9 
 
 		 124 aa  86.3  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.787189 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1071  hypothetical protein  46.85 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2483  transmembrane protein  27.08 
 
 		 122 aa  45.4  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.226347 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1218  transmembrane protein  25 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2943  hypothetical protein  28.42 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3102  transmembrane protein  30 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.766019  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0407  hypothetical protein  29.29 
 
 		 131 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3551  hypothetical protein  29.29 
 
 		 131 aa  41.6  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0392282  hitchhiker  0.000178904 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3220  putative transmembrane protein  26.32 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0352  membrane protein  30.53 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0361  membrane protein  30.53 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.485952 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2873  hypothetical protein  26.32 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0329049 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>