29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0881 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0881  putative transcriptional regulator, CadC  100 
 
 		 246 aa  501  1e-141  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0879  hypothetical protein  47.77 
 
 		 248 aa  228  6e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00268947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0757  putative transcriptional regulator, CadC  43.15 
 
 		 151 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.19634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0779  response regulator receiver protein  26.91 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.365042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3244  response regulator receiver protein  27.31 
 
 		 249 aa  110  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0793  putative transcriptional regulator, CadC  28.57 
 
 		 248 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.790637  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3347  transcriptional regulator  26.91 
 
 		 249 aa  107  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.730311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0653  hypothetical protein  28.8 
 
 		 248 aa  103  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3632  response regulator receiver protein  29.3 
 
 		 265 aa  100  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0880  transcriptional regulator, CadC  27.95 
 
 		 247 aa  100  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.102623  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3343  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  26.36 
 
 		 247 aa  98.6  8e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0940  transcriptional regulator-related protein  24.81 
 
 		 247 aa  98.2  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3240  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  25.58 
 
 		 247 aa  97.8  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0883  response regulator receiver protein  27.38 
 
 		 244 aa  97.4  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3438  winged helix family two component response transcriptional regulator  27.49 
 
 		 250 aa  97.1  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0783  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  25.58 
 
 		 247 aa  96.3  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0936  transcriptional regulator  25.81 
 
 		 248 aa  87.4  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0885  transcriptional regulator, CadC  26.8 
 
 		 246 aa  87  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2749  putative transcriptional regulator, CadC  27.06 
 
 		 251 aa  86.3  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0833  transcriptional regulator, CadC  26.27 
 
 		 249 aa  82  0.000000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3459  transcriptional regulator, CadC  26.27 
 
 		 249 aa  82  0.000000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3534  transcriptional regulator, CadC  25.97 
 
 		 249 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3653  transcriptional regulator, CadC  25.2 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.409424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0760  response regulator receiver protein  23.44 
 
 		 273 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2752  hypothetical protein  28.43 
 
 		 137 aa  47  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10264  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  32.04 
 
 		 381 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.122536 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1813  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  36.62 
 
 		 394 aa  43.1  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0320621  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0840  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  41.27 
 
 		 381 aa  42.7  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000157223  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3505  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.41 
 
 		 377 aa  42  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0781681  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>