20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0459 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0459  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  543  1e-153  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3233  hypothetical protein  31.68 
 
 
250 aa  139  7e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.306155 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0886  hypothetical protein  33.47 
 
 
259 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3061  hypothetical protein  29.93 
 
 
268 aa  125  9e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.488038  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2564  hypothetical protein  31.71 
 
 
274 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0118  PRC-barrel domain protein  28.65 
 
 
301 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143234  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0207  hypothetical protein  27.04 
 
 
248 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1677  PRC-barrel domain-containing protein  25.29 
 
 
563 aa  82  0.000000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.998848  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0107  PRC-barrel domain-containing protein  26.98 
 
 
347 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0427071  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0077  hypothetical protein  23.18 
 
 
220 aa  73.6  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0398  hypothetical protein  24.02 
 
 
349 aa  71.6  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.018855 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1649  hypothetical protein  27.39 
 
 
152 aa  62.8  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0145454 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05720  PRC-barrel domain protein  28.48 
 
 
161 aa  58.9  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.443895  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3578  hypothetical protein  25 
 
 
164 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0227988  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1850  PRC-barrel domain-containing protein  22.29 
 
 
159 aa  49.7  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3262  PRC-barrel domain-containing protein  23.15 
 
 
230 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.147497  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1194  PRC-barrel domain protein  28.81 
 
 
178 aa  47.4  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2494  PRC-barrel domain protein  26.98 
 
 
157 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3197  PRC-barrel domain-containing protein  22.4 
 
 
184 aa  45.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0772217  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2588  PRC-barrel domain protein  27.52 
 
 
195 aa  44.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000158516  hitchhiker  0.000488065 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>