51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5095 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009508  Swit_4903  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 128 aa  113  7.999999999999999e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.294667 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5095  hypothetical protein  100 
 
 		 57 aa  111  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.72528 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2450  transposase IS3/IS911  92.98 
 
 		 57 aa  105  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0659  transposase IS3/IS911  80.36 
 
 		 124 aa  88.2  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3113  transposase IS3/IS911  80.36 
 
 		 124 aa  88.2  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3087  putative transposase  80.36 
 
 		 124 aa  88.2  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.809013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2867  transposase IS3/IS911  80.36 
 
 		 124 aa  88.2  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2820  transposase IS3/IS911  80.36 
 
 		 124 aa  88.2  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2673  transposase IS3/IS911  80.36 
 
 		 124 aa  88.2  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2666  transposase IS3/IS911  80.36 
 
 		 124 aa  88.2  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0465233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2357  transposase IS3/IS911  80.36 
 
 		 124 aa  88.2  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0428135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2330  transposase IS3/IS911  80.36 
 
 		 124 aa  88.2  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.449623  normal  0.490803 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2136  transposase IS3/IS911  80.36 
 
 		 124 aa  88.2  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2100  transposase IS3/IS911  80.36 
 
 		 124 aa  88.2  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2046  transposase IS3/IS911  80.36 
 
 		 124 aa  88.2  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1965  transposase IS3/IS911  80.36 
 
 		 124 aa  88.2  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1944  transposase IS3/IS911  80.36 
 
 		 124 aa  88.2  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1931  transposase IS3/IS911  80.36 
 
 		 124 aa  88.2  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0639  transposase IS3/IS911  80.36 
 
 		 124 aa  88.2  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.198474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0783  transposase IS3/IS911  80.36 
 
 		 124 aa  88.2  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.857983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1491  transposase IS3/IS911  80.36 
 
 		 124 aa  88.2  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0660911  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0866  transposase IS3/IS911  80.36 
 
 		 124 aa  88.2  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2081  transposase IS3/IS911  80.36 
 
 		 124 aa  88.2  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0871  transposase IS3/IS911  80.36 
 
 		 124 aa  88.2  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.433518 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1017  transposase IS3/IS911  80.36 
 
 		 124 aa  88.2  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4623  transposase IS3/IS911 family protein  77.19 
 
 		 124 aa  87.8  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.453344  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1298  transposase IS3/IS911  80.36 
 
 		 109 aa  87.8  5e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2864  transposase IS3/IS911  80.36 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2434  transposase IS3/IS911  80.36 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0591246 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2408  transposase IS3/IS911  80.36 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.285932  normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2880  transposase IS3/IS911  80.36 
 
 		 124 aa  87  8e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.301854  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2942  transposase IS3/IS911  80.36 
 
 		 124 aa  87  8e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.95779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3105  transposase IS3/IS911  80.36 
 
 		 124 aa  87  8e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0869  transposase IS3/IS911  80.36 
 
 		 124 aa  87  8e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.428884 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1144  transposase IS3/IS911  80.36 
 
 		 124 aa  87  8e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.731855 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3825  transposase IS3/IS911  80.36 
 
 		 129 aa  87  8e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9079  transposase  78.95 
 
 		 124 aa  86.7  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9019  transposase  78.95 
 
 		 124 aa  86.7  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8059  transposase  77.19 
 
 		 124 aa  83.6  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.877817  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0835  transposase IS3/IS911  87.76 
 
 		 125 aa  83.6  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.907814  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4140  transposase IS3/IS911  81.13 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1263  transposase IS3/IS911  85.71 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6452  transposase IS3/IS911 family protein  80 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5452  transposase IS3/IS911 family protein  78.18 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5506  transposase IS3/IS911 family protein  78.18 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0887  transposase IS3/IS911 family protein  61.54 
 
 		 134 aa  67  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2280  transposase IS3/IS911 family protein  61.54 
 
 		 134 aa  67  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00249906  normal  0.0576324 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2283  transposase IS3/IS911 family protein  61.54 
 
 		 134 aa  67  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  normal  0.0121146 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2663  transposase IS3/IS911 family protein  61.54 
 
 		 134 aa  67  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.333405  normal  0.149935 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3375  hypothetical protein  93.75 
 
 		 43 aa  58.5  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.422861  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5395  transposase IS3/IS911 family protein  83.87 
 
 		 99 aa  50.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182536  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>