11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3095 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3095  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  289  1e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.574385 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3464  hypothetical protein  30.94 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1978  hypothetical protein  27.78 
 
 		 156 aa  47  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.335296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3527  hypothetical protein  28.57 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.471983  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2379  hypothetical protein  27.82 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  29.01 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3538  hypothetical protein  29.17 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5694  hypothetical protein  27.48 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.614955 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2288  NmrA family protein  29.77 
 
 		 450 aa  40.8  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4267  hypothetical protein  37.5 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0033  hypothetical protein  41.82 
 
 		 135 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.143375 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>