13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2857 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2857  hypothetical protein  100 
 
 		 414 aa  823    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0100445  normal  0.0264588 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0742  hypothetical protein  32.26 
 
 		 458 aa  86.7  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.205593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4704  hypothetical protein  27.75 
 
 		 317 aa  55.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.801767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000857  hypothetical protein  24.63 
 
 		 343 aa  53.5  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1334  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.33 
 
 		 512 aa  50.1  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.278248  normal  0.0416734 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0711  hypothetical protein  23.81 
 
 		 343 aa  49.7  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.926977  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  27.64 
 
 		 725 aa  47  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  28.32 
 
 		 1737 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25.64 
 
 		 878 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.27 
 
 		 632 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4030  hypothetical protein  25.53 
 
 		 317 aa  44.3  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0216774 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.24 
 
 		 810 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  33.14 
 
 		 754 aa  43.5  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>