15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1922 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1922  hypothetical protein  100 
 
 		 68 aa  138  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2318  hypothetical protein  63.93 
 
 		 89 aa  84.3  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.272642  normal  0.993319 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0412  hypothetical protein  66.67 
 
 		 66 aa  74.7  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1680  hypothetical protein  53.45 
 
 		 60 aa  62.8  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1854  hypothetical protein  53.33 
 
 		 62 aa  62.8  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12532  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0201  hypothetical protein  55.36 
 
 		 59 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.836121 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1027  hypothetical protein  55.17 
 
 		 72 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2688  hypothetical protein  55.17 
 
 		 59 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0965838  normal  0.349266 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4186  hypothetical protein  52.54 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2912  hypothetical protein  44.64 
 
 		 62 aa  54.3  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.572302 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2761  hypothetical protein  47.76 
 
 		 60 aa  52  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0068  hypothetical protein  47.37 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.471063 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1505  hypothetical protein  42.59 
 
 		 75 aa  41.2  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01400  conserved hypothetical protein  48.89 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2845  hypothetical protein  41.18 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>