45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1819 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1819  hypothetical protein  100 
 
 		 348 aa  680    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1462  hypothetical protein  63.2 
 
 		 346 aa  420  1e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0204992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1127  hypothetical protein  58.59 
 
 		 340 aa  349  4e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160448 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0034  hypothetical protein  51.82 
 
 		 332 aa  335  5.999999999999999e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2786  protein of unknown function DUF1611  51.37 
 
 		 329 aa  332  4e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2482  hypothetical protein  50.3 
 
 		 333 aa  326  3e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1206  protein of unknown function DUF1611  49.7 
 
 		 331 aa  325  5e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.356367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2789  hypothetical protein  48.74 
 
 		 333 aa  325  1e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1220  protein of unknown function DUF1611  49.85 
 
 		 330 aa  324  2e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0416  hypothetical protein  49.7 
 
 		 333 aa  322  5e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1770  hypothetical protein  49.7 
 
 		 333 aa  322  6e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3257  hypothetical protein  47.8 
 
 		 359 aa  320  3e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.161607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3166  hypothetical protein  50 
 
 		 333 aa  318  1e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4657  hypothetical protein  49.54 
 
 		 337 aa  315  7e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0366  hypothetical protein  47.88 
 
 		 333 aa  312  4.999999999999999e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4476  protein of unknown function DUF1611  49.85 
 
 		 340 aa  311  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4542  hypothetical protein  50.15 
 
 		 340 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.398083  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3968  protein of unknown function DUF1611  48.29 
 
 		 335 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0847793  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0149  protein of unknown function DUF1611  48.29 
 
 		 335 aa  306  3e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2676  hypothetical protein  48.64 
 
 		 336 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.462333  normal  0.475395 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2903  protein of unknown function DUF1611  48.34 
 
 		 336 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.141411 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06557  hypothetical protein  46.44 
 
 		 340 aa  300  2e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2798  protein of unknown function DUF1611  48.34 
 
 		 336 aa  294  1e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000678  EBNA-1 nuclear protein  46.75 
 
 		 334 aa  293  3e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2557  hypothetical protein  51.09 
 
 		 335 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1484  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1623  protein of unknown function DUF1611  42.49 
 
 		 363 aa  182  6e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.631955 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1378  protein of unknown function DUF1611  40.68 
 
 		 337 aa  180  4e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.421477 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0593  protein of unknown function DUF1611  40.68 
 
 		 340 aa  171  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2779  hypothetical protein  40.6 
 
 		 348 aa  167  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2290  protein of unknown function DUF1611  43.48 
 
 		 341 aa  162  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0205  protein of unknown function DUF1611  37.17 
 
 		 337 aa  158  1e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3589  protein of unknown function DUF1611  33.96 
 
 		 348 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0838311 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4341  protein of unknown function DUF1611  33.74 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1405  hypothetical protein  37.05 
 
 		 348 aa  150  4e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4403  protein of unknown function DUF1611  33.43 
 
 		 343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.654147  hitchhiker  0.000982381 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3511  hypothetical protein  36.56 
 
 		 348 aa  144  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.350857 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0132  hypothetical protein  33.96 
 
 		 338 aa  144  3e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0130  hypothetical protein  33.96 
 
 		 338 aa  143  4e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.550989  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2372  hypothetical protein  38.72 
 
 		 349 aa  142  8e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0792  hypothetical protein  35.74 
 
 		 365 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1538  hypothetical protein  32.03 
 
 		 353 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0852  hypothetical protein  38.76 
 
 		 360 aa  124  2e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.98076  normal  0.809264 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2299  hypothetical protein  32.96 
 
 		 392 aa  106  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1935  protein of unknown function DUF1611  31.5 
 
 		 354 aa  88.6  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.614904  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1833  hypothetical protein  28.94 
 
 		 371 aa  75.9  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>