20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0201 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0201  hypothetical protein  100 
 
 		 518 aa  1067    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.129066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1769  hypothetical protein  58.46 
 
 		 518 aa  634  1e-180  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.032794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6504  hypothetical protein  58.38 
 
 		 517 aa  622  1e-177  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3631  hypothetical protein  38.87 
 
 		 507 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0554  hypothetical protein  35.98 
 
 		 453 aa  301  1e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1974  hypothetical protein  34.26 
 
 		 525 aa  290  5.0000000000000004e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.136534 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0104  hypothetical protein  28.46 
 
 		 473 aa  183  7e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0194  hitchhiker  0.00000595624 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3856  hypothetical protein  27.41 
 
 		 480 aa  170  5e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.010908 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5756  hypothetical protein  29 
 
 		 477 aa  168  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3344  hypothetical protein  26.94 
 
 		 474 aa  163  8.000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2161  hypothetical protein  26.9 
 
 		 483 aa  150  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3762  hypothetical protein  27.45 
 
 		 485 aa  143  7e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0434  hypothetical protein  25.24 
 
 		 482 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.536677 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4040  hypothetical protein  26.02 
 
 		 473 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1065  hypothetical protein  23.26 
 
 		 473 aa  97.1  7e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1361  piwi domain-containing protein  22.78 
 
 		 473 aa  90.1  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2569  hypothetical protein  25.81 
 
 		 1063 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.682196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0336  Piwi domain protein  21.73 
 
 		 474 aa  73.9  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.412943  normal  0.652066 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0557  hypothetical protein  61.82 
 
 		 58 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.962701  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3109  hypothetical protein  22.51 
 
 		 375 aa  67.8  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>