21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_37570 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_37570  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  100 
 
 		 312 aa  595  1e-169  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.295733  normal  0.516797 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1660  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.54 
 
 		 320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2152  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.63 
 
 		 326 aa  140  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0218  hypothetical protein  45.36 
 
 		 314 aa  127  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0168  hypothetical protein  30.36 
 
 		 309 aa  107  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3316  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.25 
 
 		 314 aa  101  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000436445  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0640  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.16 
 
 		 301 aa  94.7  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.14 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.72 
 
 		 297 aa  53.9  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2030  hypothetical protein  27.96 
 
 		 308 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0852704 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.46 
 
 		 302 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2676  hypothetical protein  29.33 
 
 		 299 aa  48.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.955594  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1701  hypothetical protein  28.69 
 
 		 330 aa  47  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.228923  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0078  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.47 
 
 		 301 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.138345  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  27.16 
 
 		 308 aa  45.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3320  hypothetical protein  27.78 
 
 		 290 aa  44.3  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000781586  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4430  putative transporter  25.08 
 
 		 304 aa  44.3  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  33.77 
 
 		 317 aa  43.5  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0169  hypothetical protein  25.73 
 
 		 311 aa  43.1  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0033  carboxylate/amino acid/amine transporter  26.62 
 
 		 301 aa  42.7  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.777153  normal  0.606163 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0882  hypothetical protein  23.24 
 
 		 296 aa  42.4  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000008536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>