14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_26760 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_26760  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  370  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.14308  normal  0.557708 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3101  hypothetical protein  37.96 
 
 		 169 aa  86.7  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148369  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4703  hypothetical protein  35.06 
 
 		 168 aa  85.9  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0124469 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4646  hypothetical protein  40 
 
 		 174 aa  82.4  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0250734  normal  0.980042 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8935  hypothetical protein  29.19 
 
 		 179 aa  67.8  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00543582  normal  0.426829 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4198  hypothetical protein  29.21 
 
 		 174 aa  67  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.912124  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5077  hypothetical protein  30.16 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0984247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3237  hypothetical protein  29.87 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4211  hypothetical protein  33.07 
 
 		 160 aa  60.5  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4209  hypothetical protein  34.23 
 
 		 160 aa  53.9  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0122  hypothetical protein  31.01 
 
 		 167 aa  52  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1549  hypothetical protein  30.28 
 
 		 194 aa  51.2  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0808591  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0152  hypothetical protein  29.23 
 
 		 170 aa  49.3  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.510042  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1948  hypothetical protein  33.58 
 
 		 132 aa  48.1  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.841214  normal  0.0350761 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>