29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_12780 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_12780  Ca2+/Na+ antiporter  100 
 
 		 345 aa  663    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.63097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0538  sodium/calcium exchanger membrane region  64.74 
 
 		 347 aa  384  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.367585  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0449  sodium/calcium exchanger membrane region  64.45 
 
 		 347 aa  384  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.589797  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1849  sodium/calcium exchanger membrane region  60.12 
 
 		 361 aa  347  2e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.353414 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1499  sodium/calcium exchanger membrane region  48.04 
 
 		 339 aa  256  3e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.324742  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1450  sodium/calcium exchanger membrane region  46.63 
 
 		 355 aa  233  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.879027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3907  sodium/calcium exchanger membrane region  42.59 
 
 		 341 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.93815 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1223  Sodium/calcium exchanger membrane region  38.67 
 
 		 339 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4761  sodium/calcium exchanger membrane region  26.47 
 
 		 357 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.788461  normal  0.198903 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0274  sodium/calcium exchanger membrane region  24.77 
 
 		 343 aa  94.4  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6944  sodium/calcium exchanger membrane region  28.47 
 
 		 315 aa  92.8  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1175  sodium/calcium exchanger membrane region  24.78 
 
 		 348 aa  90.1  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.606796  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4299  sodium/calcium exchanger membrane region  26.19 
 
 		 357 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2147  sodium/calcium exchanger membrane region  27.76 
 
 		 335 aa  75.1  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2983  sodium/calcium exchanger membrane region  29.18 
 
 		 334 aa  72.8  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.39585  normal  0.0260778 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1122  sodium/calcium exchanger membrane region  25.66 
 
 		 338 aa  72  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3609  sodium/calcium exchanger membrane region  26.91 
 
 		 336 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722589 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0501  Ca2+/H+ antiporter  27.07 
 
 		 338 aa  71.2  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3831  cation antiporter (Na+/Ca2+)  28.78 
 
 		 334 aa  69.7  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151042 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0850  cation transporter, putative  26.69 
 
 		 340 aa  64.3  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.495798  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0384  sodium/calcium exchanger membrane region  23.89 
 
 		 336 aa  62  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1133  sodium/calcium exchanger membrane protein  25.24 
 
 		 334 aa  58.5  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000089866  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3080  sodium/calcium exchanger membrane protein  25.57 
 
 		 334 aa  57  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.036167  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06321  CaCA family sodium/calcium exchanger  28.32 
 
 		 359 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20130  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  23.66 
 
 		 356 aa  45.4  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1536  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  24.71 
 
 		 331 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.153216  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0831  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  24.07 
 
 		 314 aa  44.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00973668  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1817  calcium/proton exchanger  27.27 
 
 		 331 aa  44.3  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.378438  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0890  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  27.27 
 
 		 361 aa  43.5  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>