29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_02610 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_02610  Protein of unknown function (DUF2505)  100 
 
 		 164 aa  328  2e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.344177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6762  hypothetical protein  46.67 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3647  Protein of unknown function DUF2505  35.43 
 
 		 178 aa  99.4  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0645  hypothetical protein  35.76 
 
 		 169 aa  94  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0652  hypothetical protein  35.15 
 
 		 169 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196949  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0665  hypothetical protein  35.15 
 
 		 169 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0160914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0091  hypothetical protein  35.95 
 
 		 173 aa  90.9  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0822  hypothetical protein  33.33 
 
 		 168 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0780  Protein of unknown function DUF2505  28.74 
 
 		 169 aa  85.9  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.576817  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0779  Protein of unknown function DUF2505  31.68 
 
 		 166 aa  86.3  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.242967  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4964  hypothetical protein  31.9 
 
 		 164 aa  84.3  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2866  hypothetical protein  35.71 
 
 		 173 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2849  hypothetical protein  35.71 
 
 		 173 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2822  hypothetical protein  35.71 
 
 		 173 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834557  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3116  hypothetical protein  34.39 
 
 		 171 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.02824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3383  hypothetical protein  31.47 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.384179 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10489  hypothetical protein  29.56 
 
 		 174 aa  67.8  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.224481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2610  hypothetical protein  33.55 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.122572  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3798  hypothetical protein  25.9 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08430  Protein of unknown function (DUF2505)  28.44 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0644  hypothetical protein  27.95 
 
 		 167 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.125021 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0664  hypothetical protein  27.95 
 
 		 167 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0157573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0651  hypothetical protein  27.95 
 
 		 167 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100423  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3648  Protein of unknown function DUF2505  22.35 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1223  hypothetical protein  26.32 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2830  hypothetical protein  24.65 
 
 		 168 aa  53.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.257591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3048  hypothetical protein  24.82 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.323444  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1815  Protein of unknown function DUF2505  27.78 
 
 		 394 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.553226  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1222  hypothetical protein  25.9 
 
 		 160 aa  40.4  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>