17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_01280 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_01280  hypothetical protein  100 
 
 		 576 aa  1122    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.292249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2505  hypothetical protein  30.19 
 
 		 768 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4276  hypothetical protein  26.1 
 
 		 735 aa  108  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00531849  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2508  hypothetical protein  26.95 
 
 		 649 aa  69.3  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0564678  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0994  hypothetical protein  26.53 
 
 		 515 aa  65.9  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2725  hypothetical protein  26.38 
 
 		 698 aa  64.7  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1027  hypothetical protein  25.68 
 
 		 515 aa  62  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1163  hypothetical protein  26.4 
 
 		 636 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.416407  normal  0.739932 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2617  unknown, LphB  24.9 
 
 		 547 aa  50.4  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5016  hypothetical protein  25.69 
 
 		 676 aa  50.4  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.978148  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5104  hypothetical protein  25.69 
 
 		 676 aa  50.4  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5397  hypothetical protein  25.69 
 
 		 676 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.71515  normal  0.180581 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13839  transmembrane protein  26.19 
 
 		 627 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.240396  normal  0.0556328 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2744  unknown, LphB  24.9 
 
 		 546 aa  48.9  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1411  hypothetical protein  26.34 
 
 		 303 aa  47.8  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00357704  normal  0.0994638 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28170  hypothetical protein  30.46 
 
 		 601 aa  45.8  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.729962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5646  hypothetical protein  26.85 
 
 		 668 aa  44.7  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>