21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1042 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1042  outer-membrane lipoprotein carrier protein  100 
 
 
171 aa  341  2.9999999999999997e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1389  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  39.1 
 
 
171 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.948348  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0524  outer-membrane lipoprotein carrier protein  39.41 
 
 
168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1021  outer-membrane lipoprotein carrier protein  42.01 
 
 
169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.390204  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0967  outer-membrane lipoprotein carrier protein  42.41 
 
 
164 aa  106  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0777121  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0575  outer-membrane lipoprotein carrier protein  35.84 
 
 
171 aa  103  1e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.307328  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1167  outer-membrane lipoprotein carrier protein  41.14 
 
 
164 aa  102  3e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0724  outer-membrane lipoprotein carrier protein  30.77 
 
 
168 aa  78.2  0.00000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1073  outer-membrane lipoprotein carrier protein  27.22 
 
 
170 aa  77  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00225889  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1858  outer-membrane lipoprotein carrier protein  27.22 
 
 
170 aa  74.7  0.0000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.324926  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2435  outer-membrane lipoprotein carrier protein  25 
 
 
210 aa  53.9  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.699017  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1296  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.68 
 
 
208 aa  49.7  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.435605 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1669  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.76 
 
 
223 aa  49.3  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.632485  normal  0.483182 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01040  outer-membrane lipoprotein carrier protein  22.86 
 
 
216 aa  48.1  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.331194  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06126  outer-membrane lipoprotein carrier protein  22.86 
 
 
216 aa  48.1  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.294227  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1935  outer-membrane lipoprotein carrier protein  23.12 
 
 
212 aa  47.4  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.765114  normal  0.707119 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1125  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.4 
 
 
205 aa  47  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.437749 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1518  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  21.76 
 
 
273 aa  46.2  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1497  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.29 
 
 
202 aa  45.1  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.540106  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1826  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  21.31 
 
 
219 aa  41.6  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.119174  hitchhiker  0.00000680848 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28210  outer-membrane lipoprotein carrier protein  22.29 
 
 
207 aa  41.2  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.372853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>