More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3981 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1017  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  62.84 
 
 
549 aa  659    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6434  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  65.48 
 
 
572 aa  694    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441597  normal  0.0443202 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1003  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  63.2 
 
 
551 aa  683    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.265858 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5086  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  62.59 
 
 
552 aa  676    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.480357  normal  0.429273 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1782  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  77.78 
 
 
543 aa  844    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.121975  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38660  acyl-CoA dehydrogenase  70.85 
 
 
548 aa  764    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6703  acyl-CoA dehydrogenase  71.83 
 
 
539 aa  748    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619428  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6225  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  71.75 
 
 
529 aa  718    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2819  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  70.56 
 
 
543 aa  744    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.708717  normal  0.776174 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0369  acyl-CoA dehydrogenase-like  68.4 
 
 
561 aa  680    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.165313 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3981  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 
542 aa  1084    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0975  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  63.38 
 
 
551 aa  686    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315485  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4366  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  93.73 
 
 
542 aa  1025    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.128811  hitchhiker  0.00458691 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10686  acyl-CoA dehydrogenase fadE8  63.38 
 
 
542 aa  692    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2251  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  70.39 
 
 
534 aa  746    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.141599  normal  0.0458056 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0993  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  63.38 
 
 
551 aa  686    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1269  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  63.94 
 
 
551 aa  676    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.934265 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1752  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  60.41 
 
 
550 aa  607  9.999999999999999e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.907741  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0523  acyl-CoA dehydrogenase-like  55.96 
 
 
562 aa  608  9.999999999999999e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5281  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  59.96 
 
 
550 aa  588  1e-167  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.656776  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3582  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.21 
 
 
563 aa  589  1e-167  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5650  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  58.33 
 
 
542 aa  578  1e-164  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.108739  normal  0.35349 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0592  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  54.5 
 
 
555 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.684564  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2837  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.92 
 
 
563 aa  570  1e-161  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.218018  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2353  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  58.47 
 
 
557 aa  569  1e-161  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1719  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  58.14 
 
 
559 aa  560  1e-158  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.447043 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4257  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  54.28 
 
 
559 aa  556  1e-157  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.175294  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3764  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.39 
 
 
549 aa  546  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.598594  normal  0.0554036 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4943  Acyl-CoA dehydrogenase-like  53.49 
 
 
549 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12450  putative acyl-CoA dehydrogenase  53.94 
 
 
549 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.744649  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1136  putative acyl-CoA dehydrogenase  53.58 
 
 
549 aa  535  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113236  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2695  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  54.05 
 
 
545 aa  527  1e-148  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682945  normal  0.378302 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4656  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.78 
 
 
550 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.216664 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0640  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.96 
 
 
559 aa  524  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.749852  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4780  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.59 
 
 
550 aa  521  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.303527  hitchhiker  0.00591476 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4338  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  51.38 
 
 
549 aa  518  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4834  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.59 
 
 
550 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.938262  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00944  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  48.72 
 
 
560 aa  518  1.0000000000000001e-145  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.874747  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09290  acyl-CoA dehydrogenase  52.93 
 
 
571 aa  508  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.142361  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2958  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  55.84 
 
 
545 aa  509  1e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000179146  hitchhiker  0.0000711281 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4426  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  54.98 
 
 
542 aa  496  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.880642 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1847  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.64 
 
 
550 aa  496  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.440141  normal  0.493968 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3912  acyl-CoA dehydrogenase-like  48.98 
 
 
548 aa  491  1e-137  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000271467  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2916  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.19 
 
 
546 aa  488  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3763  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50.27 
 
 
561 aa  485  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.75018 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2832  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.25 
 
 
559 aa  488  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.716167  normal  0.258614 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0173  Acyl-CoA dehydrogenase  49.64 
 
 
561 aa  485  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0410  Acyl-CoA dehydrogenase  48.91 
 
 
559 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0193  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.91 
 
 
559 aa  474  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2924  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.45 
 
 
557 aa  472  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0215  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.91 
 
 
559 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.389081  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0227  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.55 
 
 
559 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2564  acyl-CoA dehydrogenase-like  49.57 
 
 
579 aa  466  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.375383 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2281  acyl-CoA dehydrogenase-like  49.27 
 
 
547 aa  460  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0161  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  47.81 
 
 
561 aa  459  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3817  acyl-CoA dehydrogenase  47.61 
 
 
548 aa  461  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3639  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.09 
 
 
553 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0204  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  48.5 
 
 
553 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0365  isovaleryl CoA dehydrogenase  47.75 
 
 
540 aa  453  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.013198 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3316  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.09 
 
 
553 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04054  isovaleryl CoA dehydrogenase  47.96 
 
 
541 aa  449  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0100  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.28 
 
 
551 aa  449  1e-125  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4431  isovaleryl CoA dehydrogenase  47.96 
 
 
541 aa  451  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4747  isovaleryl CoA dehydrogenase  47.96 
 
 
541 aa  449  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.319243  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2252  acyl-CoA dehydrogenase-like  50.19 
 
 
549 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4724  isovaleryl CoA dehydrogenase (adaptive response to DNA-methylation damage)  49.64 
 
 
547 aa  450  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2109  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  56.05 
 
 
538 aa  449  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.839474  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3826  isovaleryl CoA dehydrogenase  47.96 
 
 
541 aa  449  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000253189 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0081  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.36 
 
 
551 aa  448  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04016  hypothetical protein  47.96 
 
 
541 aa  449  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5703  isovaleryl CoA dehydrogenase  47.96 
 
 
541 aa  450  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3806  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.96 
 
 
541 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0598  acyl-CoA dehydrogenase family protein  46.69 
 
 
551 aa  448  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4645  isovaleryl CoA dehydrogenase  47.77 
 
 
540 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4655  isovaleryl CoA dehydrogenase  47.57 
 
 
540 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4658  isovaleryl CoA dehydrogenase  47.77 
 
 
541 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.61602 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0562  acyl-CoA dehydrogenase family protein  46.51 
 
 
551 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4717  isovaleryl CoA dehydrogenase  47.77 
 
 
541 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0116  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.46 
 
 
550 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2827  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  49.26 
 
 
550 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.952078  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4738  isovaleryl CoA dehydrogenase  47.38 
 
 
540 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.11297  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4795  isovaleryl CoA dehydrogenase  47.38 
 
 
540 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0438512  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4774  isovaleryl CoA dehydrogenase  47.57 
 
 
540 aa  445  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1360  acyl-CoA dehydrogenase-like  48.82 
 
 
543 aa  442  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.165599  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2006  acyl-CoA dehydrogenase  48.64 
 
 
546 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.315966  normal  0.474092 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3665  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.23 
 
 
530 aa  438  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1763  acyl-CoA dehydrogenase  48.13 
 
 
547 aa  436  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0131  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.53 
 
 
550 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3525  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.4 
 
 
549 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00283782  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2938  acyl-CoA dehydrogenase-like  47.17 
 
 
550 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1083  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.9 
 
 
538 aa  435  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0117  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.17 
 
 
550 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3788  isovaleryl CoA dehydrogenase  44.67 
 
 
547 aa  431  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0120  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.45 
 
 
564 aa  432  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2427  Acyl-CoA dehydrogenase-like  46.07 
 
 
549 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0516258 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3643  isovaleryl CoA dehydrogenase  44.67 
 
 
547 aa  431  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0687  isovaleryl CoA dehydrogenase  44.67 
 
 
547 aa  430  1e-119  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0107  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.26 
 
 
550 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3025  acyl-CoA dehydrogenase-like  46.17 
 
 
551 aa  428  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285589  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0440  isovaleryl CoA dehydrogenase  45.77 
 
 
544 aa  426  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000763646 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>