35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3182 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3182  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  408  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.429032 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3408  hypothetical protein  87.56 
 
 		 209 aa  362  2e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1443  hypothetical protein  51.2 
 
 		 211 aa  189  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.210948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2927  hypothetical protein  48.56 
 
 		 210 aa  178  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.549173 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4607  hypothetical protein  44.76 
 
 		 210 aa  172  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0303145  hitchhiker  0.0000208711 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0630  hypothetical protein  49.52 
 
 		 207 aa  168  4e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0331446 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0452  hypothetical protein  46.38 
 
 		 205 aa  162  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0463  hypothetical protein  46.38 
 
 		 205 aa  162  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.78842 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0267  hypothetical protein  47.12 
 
 		 207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2970  hypothetical protein  44.28 
 
 		 238 aa  160  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0094971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0439  hypothetical protein  45.89 
 
 		 205 aa  159  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.471698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3980  hypothetical protein  47.85 
 
 		 203 aa  157  9e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5808  hypothetical protein  43.5 
 
 		 206 aa  155  6e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0865  hypothetical protein  53.49 
 
 		 221 aa  154  8e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.642531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12830  conserved hypothetical protein TIGR03085  44.29 
 
 		 248 aa  154  1e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.213535  normal  0.0190582 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2240  hypothetical protein  38.65 
 
 		 209 aa  146  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.168407  normal  0.37732 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2192  hypothetical protein  41.23 
 
 		 210 aa  138  6e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1677  hypothetical protein  36.62 
 
 		 220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.47521e-17 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0292  hypothetical protein  39.23 
 
 		 220 aa  126  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1770  hypothetical protein  44.22 
 
 		 205 aa  124  8.000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.92711  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3035  hypothetical protein  40.2 
 
 		 210 aa  122  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0510116  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3229  hypothetical protein  41.58 
 
 		 207 aa  122  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1682  hypothetical protein  34.74 
 
 		 214 aa  119  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.087821  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10040  hypothetical protein  38.21 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0305113  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15570  conserved hypothetical protein TIGR03085  40.29 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2229  hypothetical protein  39.9 
 
 		 207 aa  105  7e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11958  hypothetical protein  40.56 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0608324  normal  0.971894 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6520  hypothetical protein  33.48 
 
 		 240 aa  101  9e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.223836  normal  0.0543517 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1996  hypothetical protein  40.7 
 
 		 210 aa  96.3  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1129  hypothetical protein  32.34 
 
 		 225 aa  86.3  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20820  conserved hypothetical protein TIGR03085  31.12 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.395226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3206  hypothetical protein  29.7 
 
 		 200 aa  46.6  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000108092  hitchhiker  0.000809588 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3528  hypothetical protein  29.71 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3596  hypothetical protein  27.54 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3523  hypothetical protein  27.54 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>