14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2698 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2698  hypothetical protein  100 
 
 		 328 aa  656    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0912679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7000  hypothetical protein  66.57 
 
 		 328 aa  447  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574951 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4118  hypothetical protein  72.51 
 
 		 353 aa  422  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2178  hypothetical protein  68.31 
 
 		 320 aa  395  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.319459  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4111  hypothetical protein  59.36 
 
 		 344 aa  331  9e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0556  hypothetical protein  56.38 
 
 		 345 aa  326  4.0000000000000003e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6359  hypothetical protein  53.05 
 
 		 339 aa  295  7e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400422  normal  0.240058 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0694  hypothetical protein  52.01 
 
 		 305 aa  275  9e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0871  hypothetical protein  49.33 
 
 		 305 aa  263  4e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0597  hypothetical protein  48.34 
 
 		 409 aa  256  4e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.626132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0867  hypothetical protein  45.48 
 
 		 305 aa  245  6.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8248  hypothetical protein  39.08 
 
 		 320 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0300735 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  29.29 
 
 		 951 aa  90.9  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4566  hypothetical protein  29.48 
 
 		 286 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712352 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>