18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0207 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0207  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  180  7e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0236  major facilitator transporter  85.57 
 
 		 402 aa  130  6.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00072705 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  41.98 
 
 		 429 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1093  major facilitator superfamily MFS_1  38.75 
 
 		 408 aa  49.7  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2962  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 461 aa  49.3  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.470581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  43.28 
 
 		 451 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2101  major facilitator superfamily MFS_1  36.51 
 
 		 447 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0419  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 416 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  42.25 
 
 		 411 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 431 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  32.97 
 
 		 432 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0234  major facilitator superfamily MFS_1  34.18 
 
 		 442 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  44.23 
 
 		 435 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  43.08 
 
 		 417 aa  41.6  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  33.75 
 
 		 410 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  34.09 
 
 		 426 aa  40.8  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  31.65 
 
 		 420 aa  40.4  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  45.1 
 
 		 411 aa  40.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>