25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1978 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_1978  hypothetical protein  100 
 
 		 398 aa  806    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0514587  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1035  hypothetical protein  40.62 
 
 		 411 aa  307  3e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0477  hypothetical protein  40.29 
 
 		 435 aa  290  3e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2369  hypothetical protein  31.03 
 
 		 413 aa  192  1e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3328  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component-like protein  27.68 
 
 		 405 aa  181  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.703732  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0344  hypothetical protein  28.54 
 
 		 417 aa  181  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0687151  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1676  hypothetical protein  27.32 
 
 		 410 aa  169  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.539323 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0444  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component-like protein  31.33 
 
 		 360 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2104  hypothetical protein  27.48 
 
 		 409 aa  152  8e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2261  hypothetical protein  27.1 
 
 		 361 aa  130  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2265  hypothetical protein  26.09 
 
 		 372 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0678841  normal  0.713238 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02430  hypothetical protein  25.22 
 
 		 353 aa  110  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0596996  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2096  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component-like protein  22.53 
 
 		 401 aa  77  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.735031  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1201  extracellular solute-binding protein family 1  30.13 
 
 		 320 aa  69.3  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.941139  normal  0.523727 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00460  hypothetical protein  24.19 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.131155  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1685  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component-like protein  20.83 
 
 		 291 aa  53.5  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.516639  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1990  hypothetical protein  18.61 
 
 		 351 aa  53.1  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1913  extracellular solute-binding protein family 1  25.13 
 
 		 348 aa  50.8  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0831866  normal  0.645841 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4840  putative ABC transporter periplasmic binding component  26.04 
 
 		 340 aa  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0305994 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0120  extracellular solute-binding protein  24.67 
 
 		 340 aa  47  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3124  extracellular solute-binding protein  24.07 
 
 		 345 aa  45.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0486  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.26 
 
 		 333 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.64062  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3454  putative periplasmic solute-binding protein  25.89 
 
 		 337 aa  44.3  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.357351  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4695  extracellular solute-binding protein  26.2 
 
 		 333 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1586  extracellular solute-binding protein family 1  22.82 
 
 		 333 aa  43.5  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>