10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2681 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2681  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 114 aa  224  3e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1278  DNA polymerase beta subunit  63.25 
 
 		 113 aa  141  3e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1689  DNA polymerase beta subunit  53.98 
 
 		 122 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000949041  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0999  DNA polymerase beta subunit  53.1 
 
 		 114 aa  124  5e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0343888  hitchhiker  0.00940331 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0991  DNA polymerase beta subunit  54.87 
 
 		 111 aa  121  4e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1435  DNA polymerase beta subunit  42.45 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000000437505  decreased coverage  0.0000020199 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1268  DNA polymerase beta subunit  42.42 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.834804 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0218  DNA polymerase beta subunit  30.43 
 
 		 110 aa  46.2  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2826  DNA polymerase beta domain protein region  48.98 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.126118  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0503  DNA polymerase beta subunit  27.08 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00191521 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>