15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0819 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0819  transcriptional regulator, AbrB family  100 
 
 		 73 aa  143  9e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2441  transcriptional regulator, AbrB family  50 
 
 		 79 aa  55.5  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.189768  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2127  AbrB family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 90 aa  53.5  0.0000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1708  AbrB family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0393  AbrB family transcriptional regulator  54.35 
 
 		 80 aa  48.9  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1031  transcriptional regulator, AbrB family  53.66 
 
 		 54 aa  48.1  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.370823  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1354  AbrB family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0871644 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1487  transcriptional regulator, AbrB family  51.22 
 
 		 51 aa  46.2  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.490723  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1468  AbrB family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 51 aa  45.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2028  AbrB family transcriptional regulator  56.76 
 
 		 54 aa  45.4  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.50101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0687  AbrB family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000068736  unclonable  0.00000000733097 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0959  AbrB family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 81 aa  42  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.538294  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1610  AbrB family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 79 aa  42  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00130858  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0868  transcriptional regulator, AbrB family  51.22 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.300001  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2774  transcriptional regulator, AbrB family  45 
 
 		 78 aa  40.4  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>