18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4189 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4189  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  426  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0757327  normal  0.729118 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0315  hypothetical protein  67.44 
 
 		 206 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0405  hypothetical protein  67.94 
 
 		 208 aa  274  7e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0270  hypothetical protein  64.42 
 
 		 211 aa  265  2.9999999999999995e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0404  hypothetical protein  64.42 
 
 		 191 aa  244  8e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3459  hypothetical protein  31.8 
 
 		 179 aa  92.8  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3635  hypothetical protein  31.8 
 
 		 179 aa  92  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4241  outer membrane protein H1  30.52 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.186176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4201  outer membrane protein H1 precursor  29.81 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225205  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49200  PhoP/Q and low Mg2+ inducible outer membrane prote  29.91 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152056 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1215  outer membrane protein H1  29.25 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2977  hypothetical protein  30.24 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.128121 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1120  outer membrane insertion C-terminal signal  29.73 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000147263  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1197  outer membrane protein H1  28.77 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.397071  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1185  outer membrane protein H1  29.25 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.247774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4231  outer membrane protein H1  29.25 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.91755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0560  outer membrane insertion C-terminal signal  25.91 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.439899  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0009  possible outer membrane protein  22.07 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>