55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4095 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4095  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  100 
 
 		 347 aa  715    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0528  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  78.2 
 
 		 344 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3372  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  74.06 
 
 		 347 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.537217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3791  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  71.43 
 
 		 344 aa  512  1e-144  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3550  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  67.05 
 
 		 350 aa  476  1e-133  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0123013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0406  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  66.76 
 
 		 350 aa  476  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0251824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3724  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  66.28 
 
 		 350 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.265365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0507  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  64.57 
 
 		 354 aa  461  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3894  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  64.86 
 
 		 354 aa  461  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.015316  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0420  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  65.14 
 
 		 354 aa  463  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0446  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  65.14 
 
 		 354 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0823821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0432  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  64.86 
 
 		 354 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185198  hitchhiker  0.000543609 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0476  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  64.18 
 
 		 342 aa  449  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0462  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  65.28 
 
 		 338 aa  442  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3201  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  62.17 
 
 		 345 aa  424  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.791135  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4198  arginase family protein  70.04 
 
 		 271 aa  390  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4572  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  37.42 
 
 		 348 aa  206  4e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.708265  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09036  Formiminoglutamate hydrolase  32.95 
 
 		 329 aa  167  2e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.122241  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4273  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  33.97 
 
 		 323 aa  157  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0938  formimidoylglutamase  28.47 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.62567 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0883  formimidoylglutamase  28.62 
 
 		 313 aa  69.7  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0852  formimidoylglutamase  28.28 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0915  formimidoylglutamase  27.34 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0824  formimidoylglutamase  27.34 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2046  formimidoylglutamase  27.91 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.55166  normal  0.477762 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1596  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  26.91 
 
 		 316 aa  59.3  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1279  formiminoglutamase  28.81 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2795  formimidoylglutamase  30.59 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02330  formimidoylglutamase  27.17 
 
 		 348 aa  55.5  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2388  formimidoylglutamase  25.26 
 
 		 315 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.770652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1261  formimidoylglutamase  27.84 
 
 		 312 aa  55.8  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2010  formiminoglutamase  25.19 
 
 		 333 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.547952  normal  0.0717595 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4413  formimidoylglutamase  26 
 
 		 320 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.624184 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2157  formiminoglutamase  25.98 
 
 		 322 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0149  arginase  28.12 
 
 		 299 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1591  formimidoylglutamase  26.24 
 
 		 316 aa  49.7  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854602  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5045  formimidoylglutamase  28.29 
 
 		 329 aa  49.3  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2732  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  26.35 
 
 		 311 aa  49.3  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.167247  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4072  formimidoylglutamase  31.32 
 
 		 311 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03170  formiminoglutamase  26.47 
 
 		 317 aa  48.1  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0599  formimidoylglutamase  26.8 
 
 		 325 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00699527 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0153  arginase  26.39 
 
 		 300 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000739593  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30730  formiminoglutamase  26.02 
 
 		 329 aa  47.8  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1954  formimidoylglutamase  28.49 
 
 		 311 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0479136  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2879  formimidoylglutamase  23.1 
 
 		 325 aa  46.2  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0849  formimidoylglutamase  23.97 
 
 		 358 aa  45.8  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0322036 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2473  formimidoylglutamase  23.47 
 
 		 325 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1824  agmatinase  22.76 
 
 		 282 aa  43.9  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2764  agmatinase  25.39 
 
 		 345 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.255476  normal  0.814002 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0379  formimidoylglutamase  25.78 
 
 		 323 aa  43.9  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1461  arginase  25.57 
 
 		 299 aa  43.5  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.229743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2778  agmatinase  24.87 
 
 		 345 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2035  putative agmatinase  24.86 
 
 		 324 aa  43.5  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.108559  normal  0.06349 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2734  agmatinase  24.87 
 
 		 345 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1085  agmatinase  20.1 
 
 		 282 aa  43.5  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>