141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3509 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_1170  metalloendopeptidase PepO  64.32 
 
 
687 aa  948    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0429  M13 family peptidase  48.78 
 
 
680 aa  676    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3844  M13 family peptidase  80.12 
 
 
694 aa  1172    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1089  endothelin-converting protein 1  76.83 
 
 
695 aa  1128    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000391271  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3353  endothelin-converting protein 1  48.42 
 
 
693 aa  694    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000120839  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0433  endothelin-converting protein 1  48.63 
 
 
680 aa  678    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000749022  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3179  endothelin-converting protein 1  81.7 
 
 
694 aa  1188    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00771083  normal  0.176468 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0787  endothelin-converting protein 1  81.41 
 
 
694 aa  1183    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.945609  normal  0.609881 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3594  endothelin-converting protein 1  48.63 
 
 
680 aa  677    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00014844  normal  0.311566 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0842  endothelin-converting protein 1  76.55 
 
 
695 aa  1104    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000483693  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3557  Endothelin-converting enzyme 1  81.56 
 
 
694 aa  1207    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000106684  normal  0.0284487 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3851  Endothelin-converting enzyme 1  48.63 
 
 
680 aa  685    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000731765  unclonable  0.00000000000213103 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0431  peptidase M13  48.35 
 
 
680 aa  676    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000285059  normal  0.587511 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0759  peptidase M13  81.41 
 
 
694 aa  1187    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000318584  normal  0.501686 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0380  endothelin-converting protein 1  48.14 
 
 
686 aa  671    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000833432  normal  0.388237 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2615  endothelin-converting protein 1  79.86 
 
 
695 aa  1152    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.602368  normal  0.883859 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0685  endothelin-converting protein 1  81.41 
 
 
694 aa  1204    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000174697  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3908  endothelin-converting protein 1  48.49 
 
 
680 aa  682    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000304576  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2973  endothelin-converting protein 1  85.45 
 
 
694 aa  1253    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0149701  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3426  endothelin-converting protein 1  48.49 
 
 
684 aa  699    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000894616  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0791  endothelin-converting protein 1  81.99 
 
 
694 aa  1197    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.760181  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3412  endothelin-converting protein 1  48.49 
 
 
680 aa  678    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000019891  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3687  Neprilysin  48.98 
 
 
681 aa  686    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.961749  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3625  endothelin-converting protein 1  81.96 
 
 
654 aa  1141    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3928  endothelin-converting protein 1  48.63 
 
 
680 aa  685    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151438  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0436  endothelin-converting protein 1  46.91 
 
 
684 aa  677    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000525642  decreased coverage  0.00000000576853 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3509  endothelin-converting protein 1  100 
 
 
694 aa  1431    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000108366  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3177  endothelin-converting protein 1  82.85 
 
 
694 aa  1229    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000449633  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3748  endothelin-converting protein 1  81.41 
 
 
694 aa  1205    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000230023  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4049  endothelin-converting protein 1  48.49 
 
 
680 aa  683    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000180247  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0324  endothelin-converting protein 1  48.7 
 
 
684 aa  694    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000623227  decreased coverage  0.00121593 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0911  endothelin-converting protein 1  87.18 
 
 
694 aa  1278    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000483168  normal  0.830328 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00685  metalloendopeptidase PepO  49.49 
 
 
688 aa  708    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24530  endothelin-converting enzyme  48.02 
 
 
673 aa  633  1e-180  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0503062  normal  0.743342 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4490  Neprilysin  46.83 
 
 
670 aa  623  1e-177  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1104  Neprilysin  46.87 
 
 
671 aa  624  1e-177  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0419404  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0157  PgPepO oligopeptidase  47.59 
 
 
672 aa  618  1e-176  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0166  PgPepO oligopeptidase  47.59 
 
 
664 aa  619  1e-176  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0472  neprilysin  48.17 
 
 
666 aa  621  1e-176  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0927032  normal  0.0519696 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4429  Endothelin-converting enzyme 1  46.46 
 
 
659 aa  618  1e-176  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.437954  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0184  neprilysin  46.87 
 
 
673 aa  617  1e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0147  PgPepO oligopeptidase  47.29 
 
 
664 aa  613  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.101212 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1958  endothelin-converting protein 1  46.1 
 
 
689 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000435105  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3239  endothelin-converting protein 1  45.71 
 
 
692 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3909  endothelin-converting protein 1  46.15 
 
 
690 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000503198  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3633  endothelin-converting protein 1  45.14 
 
 
689 aa  600  1e-170  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000899606  decreased coverage  0.0000004601 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1440  neutral zinc metallopeptidase M13 family protein  44.62 
 
 
687 aa  595  1e-169  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10200  zinc metalloprotease  46.02 
 
 
663 aa  597  1e-169  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.409138  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0163  endothelin-converting protein 1  45.34 
 
 
687 aa  594  1e-168  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.847092 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02849  putative peptidase M13 family protein  44.41 
 
 
695 aa  591  1e-167  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.535819  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1374  Neprilysin  46.22 
 
 
662 aa  590  1e-167  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.367096  hitchhiker  0.00589485 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4678  endothelin-converting protein 1  44.66 
 
 
722 aa  587  1e-166  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.44527 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1728  endothelin-converting protein 1  45.9 
 
 
686 aa  582  1.0000000000000001e-165  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0946  Endothelin-converting enzyme 1  46.35 
 
 
665 aa  580  1e-164  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1065  Endothelin-converting enzyme 1  43.19 
 
 
679 aa  578  1.0000000000000001e-163  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.824291 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0473  endothelin-converting protein 1  42.45 
 
 
695 aa  578  1.0000000000000001e-163  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.190105  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0474  endothelin-converting protein 1  43.29 
 
 
692 aa  578  1.0000000000000001e-163  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00398267  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0116  Neprilysin  44.93 
 
 
651 aa  575  1.0000000000000001e-162  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2227  endothelin-converting protein 1  46.63 
 
 
680 aa  559  1e-158  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0489343  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1239  Endothelin-converting enzyme 1  42.53 
 
 
678 aa  552  1e-156  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4486  Endothelin-converting enzyme 1  43.78 
 
 
673 aa  553  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000750073  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1964  Endothelin-converting enzyme 1  44.77 
 
 
650 aa  551  1e-155  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000041678 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0131  endothelin-converting protein 1  43.32 
 
 
649 aa  548  1e-154  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.029376  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3364  endothelin-converting protein 1  42.99 
 
 
651 aa  548  1e-154  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4614  endothelin-converting protein 1  43.35 
 
 
668 aa  542  1e-153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0428  Endothelin-converting enzyme 1  40.77 
 
 
703 aa  545  1e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.386661  normal  0.0478965 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0346  Neprilysin  44.07 
 
 
676 aa  540  9.999999999999999e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0959  endothelin-converting protein 1  39.8 
 
 
698 aa  540  9.999999999999999e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0167  Endothelin-converting enzyme 1  41.6 
 
 
692 aa  538  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0514  endothelin-converting protein 1  43.12 
 
 
681 aa  536  1e-151  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.296446  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1810  neprilysin  42.68 
 
 
683 aa  537  1e-151  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5682  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_002950  PG0159  endopeptidase PepO  40.9 
 
 
689 aa  532  1e-150  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03039  metallopeptidase  39.2 
 
 
701 aa  532  1e-150  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4515  PgPepO oligopeptidase  40.52 
 
 
685 aa  531  1e-149  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.857143  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03930  Peptidase, M13 family (lipoprotein)  39.31 
 
 
688 aa  530  1e-149  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.254642  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0491  M13 family peptidase  39.13 
 
 
711 aa  527  1e-148  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1199  Endothelin-converting enzyme 1  41.35 
 
 
697 aa  526  1e-148  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.108357 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1078  PgPepO oligopeptidase  39.88 
 
 
683 aa  522  1e-147  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00182798  normal  0.0175164 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11790  endothelin-converting enzyme  43.15 
 
 
676 aa  524  1e-147  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.770299  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4331  Endothelin-converting enzyme 1  40.18 
 
 
679 aa  524  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2660  hypothetical protein  40.19 
 
 
678 aa  521  1e-146  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2530  hypothetical protein  40.19 
 
 
678 aa  521  1e-146  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2621  Neprilysin  42.57 
 
 
661 aa  520  1e-146  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.792249  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3531  endothelin-converting protein 1  38.62 
 
 
710 aa  520  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3866  endothelin-converting protein 1  38.1 
 
 
704 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3991  endothelin-converting protein 1  37.96 
 
 
704 aa  518  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.720524  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1996  Endothelin-converting enzyme 1  40.14 
 
 
687 aa  516  1.0000000000000001e-145  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.451521  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0499  endothelin-converting protein 1  38.48 
 
 
710 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3809  Endothelin-converting enzyme 1  37.96 
 
 
704 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.722152  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0500  peptidase M13  38.76 
 
 
710 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0450  endothelin-converting protein 1  37.82 
 
 
704 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1725  endothelin-converting protein 1  38.8 
 
 
682 aa  509  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.172464 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2834  PgPepO oligopeptidase  38.23 
 
 
694 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0726503  normal  0.179326 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3155  endothelin-converting protein 1  40.39 
 
 
692 aa  508  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04757  metallopeptidase  39.68 
 
 
685 aa  508  9.999999999999999e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.515497  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1075  peptidase family M13  39.86 
 
 
711 aa  505  1e-141  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3401  Endothelin-converting enzyme 1  38.01 
 
 
709 aa  504  1e-141  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2006  endothelin-converting protein 1  38.58 
 
 
678 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21550  endothelin-converting enzyme  40.21 
 
 
662 aa  502  1e-140  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00980776  hitchhiker  0.000469406 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0811  Endothelin-converting enzyme 1  40.15 
 
 
658 aa  501  1e-140  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.446841  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>