30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0540 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0540  biogenesis protein MshI  100 
 
 		 304 aa  623  1e-177  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4421  biogenesis protein MshI  66.21 
 
 		 301 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0480  biogenesis protein MshI  58.84 
 
 		 292 aa  349  4e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0501  biogenesis protein MshI  58.5 
 
 		 292 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3839  biogenesis protein MshI  58.16 
 
 		 292 aa  345  5e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0504  biogenesis protein MshI  58.16 
 
 		 292 aa  345  7e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4114.2  biogenesis protein MshI  57.48 
 
 		 292 aa  335  7e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0462  biogenesis protein MshI  57.82 
 
 		 292 aa  332  4e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.572153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3490  biogenesis protein MshI  57.82 
 
 		 292 aa  332  6e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3667  biogenesis protein MshI  58.16 
 
 		 292 aa  330  2e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0556  biogenesis protein MshI  58.16 
 
 		 292 aa  323  2e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3772  biogenesis protein MshI  58.05 
 
 		 293 aa  318  7e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0385  biogenesis protein MshI  51.02 
 
 		 292 aa  296  2e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0450  biogenesis protein MshI  50.17 
 
 		 289 aa  295  9e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3351  biogenesis protein MshI  48.64 
 
 		 292 aa  269  5e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3755  biogenesis protein MshI  47.5 
 
 		 301 aa  250  3e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0166  hypothetical protein  38.76 
 
 		 310 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.927956  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00247  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshI (pilus type IV)  36.65 
 
 		 304 aa  118  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1131  hypothetical protein  34.03 
 
 		 313 aa  87.8  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0749  hypothetical protein  29.24 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.127849  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2817  MSHA biogenesis protein MshI  27.91 
 
 		 479 aa  79.3  0.00000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0466  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHI)  29.09 
 
 		 487 aa  76.3  0.0000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0327432  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3278  hypothetical protein  29.38 
 
 		 330 aa  74.7  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0760  hypothetical protein  27.63 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0373973  normal  0.392235 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3092  hypothetical protein  30.09 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0889  hypothetical protein  31.76 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0381  MshA biogenesis protein MshI-1  28.96 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03701  hypothetical protein  27.45 
 
 		 482 aa  63.9  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002365  MSHA biogenesis protein MshI  27.78 
 
 		 481 aa  63.9  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3336  hypothetical protein  24.4 
 
 		 365 aa  50.8  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>