24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9099 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9099  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  268  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0481  hypothetical protein  37.9 
 
 		 145 aa  101  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571872  normal  0.104037 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9190  hypothetical protein  40.26 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8102  hypothetical protein  35.87 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8527  hypothetical protein  36.94 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0143221 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0165  hypothetical protein  34.65 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6386  hypothetical protein  32.99 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.320315  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3877  hypothetical protein  34.44 
 
 		 114 aa  47  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.598756  normal  0.10934 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0649  conserved hypothetical protein DUF149  36 
 
 		 114 aa  47  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0145182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0111  hypothetical protein  30.68 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.452353  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2366  hypothetical protein  33.73 
 
 		 114 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.242324  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3648  hypothetical protein  31.87 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.801413  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0711  hypothetical protein  33.73 
 
 		 114 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0520  hypothetical protein  34.72 
 
 		 114 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.149206  normal  0.329373 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0033  hypothetical protein  29.7 
 
 		 107 aa  43.9  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.124063  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0033  hypothetical protein  29.7 
 
 		 107 aa  43.9  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0434672  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0022  hypothetical protein  29.7 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121154  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36560  conserved hypothetical protein TIGR00103  29.27 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.29616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0443  hypothetical protein  32.41 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05930  hypothetical protein  34.02 
 
 		 187 aa  41.6  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2675  hypothetical protein  26.85 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4076  hypothetical protein  26.73 
 
 		 107 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4396  hypothetical protein  26.73 
 
 		 107 aa  40.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1509  hypothetical protein  24.24 
 
 		 107 aa  40.8  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0528919  normal  0.482179 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>