14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6386 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6386  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  320  5e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.320315  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05930  hypothetical protein  49.31 
 
 		 187 aa  108  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4831  hypothetical protein  35.59 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000648077 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0934  hypothetical protein  36.84 
 
 		 163 aa  51.6  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9099  hypothetical protein  32.99 
 
 		 134 aa  51.6  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4221  hypothetical protein  37.25 
 
 		 184 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0535  hypothetical protein  37.5 
 
 		 147 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000537428  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8485  hypothetical protein  31.86 
 
 		 137 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1261  hypothetical protein  41.33 
 
 		 103 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23530  hypothetical protein  27.66 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0377925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0481  hypothetical protein  30.21 
 
 		 145 aa  43.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571872  normal  0.104037 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07840  hypothetical protein  30.39 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8102  hypothetical protein  26.83 
 
 		 134 aa  42.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9190  hypothetical protein  30.53 
 
 		 133 aa  40.8  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>