More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7138 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00611  leucyl-tRNA synthetase  40.46 
 
 		 860 aa  637    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.197817  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2984  leucyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 		 860 aa  635    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00147705  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0194  leucyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 		 813 aa  741    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.159225  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2209  leucyl-tRNA synthetase  48.61 
 
 		 824 aa  808    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4794  leucyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 		 868 aa  712    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.232287 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2339  leucyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 		 858 aa  701    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000153257  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1318  leucyl-tRNA synthetase  45.18 
 
 		 804 aa  733    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1453  leucyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 887 aa  657    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.721273  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4882  leucyl-tRNA synthetase  46.63 
 
 		 802 aa  734    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1722  leucyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 		 863 aa  647    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2145  leucyl-tRNA synthetase  47.82 
 
 		 817 aa  727    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.736456  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2057  leucyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 833 aa  651    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00764641  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1295  leucyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 		 806 aa  668    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000279205  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1174  leucyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 859 aa  661    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4812  leucyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 868 aa  707    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4637  leucyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 		 802 aa  740    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.802633  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4472  leucyl-tRNA synthetase  47.13 
 
 		 802 aa  738    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.947334  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4490  leucyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 		 802 aa  740    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09941  leucyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 		 862 aa  689    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.880556  normal  0.45126 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1302  leucyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 		 823 aa  676    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1301  leucyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 823 aa  676    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4352  leucyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 868 aa  715    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.964178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0576  leucyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 		 921 aa  635    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.931447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0544  leucyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 		 876 aa  658    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.697697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2156  leucyl-tRNA synthetase  77.59 
 
 		 830 aa  1323    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0321  leucyl-tRNA synthetase  38.91 
 
 		 862 aa  689    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.955307  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2445  leucyl-tRNA synthetase  44.09 
 
 		 857 aa  669    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00377193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3269  leucyl-tRNA synthetase  40.39 
 
 		 874 aa  654    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4936  leucyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 		 872 aa  739    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2515  leucyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 		 827 aa  779    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000585626  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2665  leucyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 		 819 aa  707    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.364748  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4957  leucyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 		 868 aa  705    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0171  leucyl-tRNA synthetase  40.84 
 
 		 874 aa  635    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1413  leucyl-tRNA synthetase  47.45 
 
 		 851 aa  774    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000816015  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2929  leucyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 863 aa  660    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.010661 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1106  leucyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 		 884 aa  749    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629487  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1380  leucyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 		 875 aa  770    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.922349  normal  0.216701 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2300  leucyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 		 824 aa  813    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.284228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2439  leucyl-tRNA synthetase  46.64 
 
 		 829 aa  772    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0479  leucyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 		 877 aa  686    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4991  leucyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 		 802 aa  740    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2863  leucyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 859 aa  649    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0256  leucyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 		 823 aa  825    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1920  leucyl-tRNA synthetase  46.23 
 
 		 865 aa  762    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0511  leucyl-tRNA synthetase  42.87 
 
 		 866 aa  679    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711035  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09711  leucyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 		 864 aa  635    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.217305  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3631  leucyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 		 862 aa  673    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0568  leucyl-tRNA synthetase  48.92 
 
 		 829 aa  818    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0478  leucyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 		 894 aa  650    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2727  leucyl-tRNA synthetase  47.05 
 
 		 858 aa  728    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.354364  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1813  leucyl-tRNA synthetase  44.93 
 
 		 805 aa  692    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.682245  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3215  leucyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 		 848 aa  661    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4669  leucyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 		 906 aa  712    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09721  leucyl-tRNA synthetase  38.77 
 
 		 856 aa  656    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.90709  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3308  leucyl-tRNA synthetase  43.72 
 
 		 819 aa  667    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0417159 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0284  leucyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 		 882 aa  650    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.366179  normal  0.453958 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2155  leucyl-tRNA synthetase  44.71 
 
 		 817 aa  699    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1861  leucyl-tRNA synthetase  48.8 
 
 		 829 aa  803    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.911399  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4197  leucyl-tRNA synthetase  44.41 
 
 		 859 aa  743    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0797  leucyl-tRNA synthetase  40.39 
 
 		 872 aa  650    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.749816  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4535  leucyl-tRNA synthetase  45.87 
 
 		 904 aa  752    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15061  leucyl-tRNA synthetase  45.43 
 
 		 878 aa  734    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.136372 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3134  leucyl-tRNA synthetase  48.31 
 
 		 824 aa  806    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0566  leucyl-tRNA synthetase  40.11 
 
 		 934 aa  636    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.632616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09701  leucyl-tRNA synthetase  38.07 
 
 		 856 aa  641    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0232  leucyl-tRNA synthetase  39.91 
 
 		 861 aa  652    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1328  leucyl-tRNA synthetase  46.44 
 
 		 856 aa  764    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0567  leucyl-tRNA synthetase  48.18 
 
 		 819 aa  730    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0791746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0045  leucyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 		 857 aa  635    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.269909 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1237  leucyl-tRNA synthetase  46.99 
 
 		 825 aa  814    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2744  leucyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 		 864 aa  671    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3202  leucyl-tRNA synthetase  48.32 
 
 		 817 aa  788    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1566  leucyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 		 870 aa  679    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.408978  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3209  leucyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 		 871 aa  636    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0657  leucyl-tRNA synthetase  45.23 
 
 		 816 aa  714    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0645  leucyl-tRNA synthetase  45.23 
 
 		 816 aa  728    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0757  leucyl-tRNA synthetase  47.88 
 
 		 824 aa  813    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1704  leucyl-tRNA synthetase  47.79 
 
 		 929 aa  659    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0997  leucyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 		 859 aa  652    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.248445  normal  0.169991 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1062  leucyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 		 859 aa  655    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0109864 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0400  leucyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 		 864 aa  689    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.8894  normal  0.692139 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0705  leucyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 872 aa  648    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.173652  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1599  leucyl-tRNA synthetase  47.22 
 
 		 824 aa  795    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000190725  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2957  leucyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 865 aa  668    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12230  leucyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 		 873 aa  690    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.726587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1830  leucyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 		 885 aa  638    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000180748 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0839  leucyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 829 aa  662    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.435731  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0459  leucyl-tRNA synthetase  44.16 
 
 		 804 aa  685    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0456991  normal  0.0638031 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0635  leucyl-tRNA synthetase  44.47 
 
 		 808 aa  714    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0268  leucyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 		 833 aa  659    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2247  leucyl-tRNA synthetase  71.95 
 
 		 843 aa  1196    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1191  leucyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 859 aa  649    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.663748 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2084  leucyl-tRNA synthetase  47.91 
 
 		 829 aa  770    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.276133  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0432  leucyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 859 aa  687    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0302206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1001  leucyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 		 859 aa  655    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.355839  normal  0.124376 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0771  leucyl-tRNA synthetase  72.92 
 
 		 832 aa  1213    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.286234  normal  0.18971 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0159  leucyl-tRNA synthetase  45.68 
 
 		 813 aa  757    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1731  leucyl-tRNA synthetase  48.85 
 
 		 823 aa  802    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.308382  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3786  leucyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 		 906 aa  703    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.731933 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1884  leucyl-tRNA synthetase  65.87 
 
 		 848 aa  1105    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.439942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>