12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4960 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4960  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  462  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0619333  normal  0.992711 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0426  alkylmercury lyase  73.89 
 
 		 226 aa  349  2e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05502  putative transmembrane protein  29.28 
 
 		 225 aa  97.4  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.362659 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  33.72 
 
 		 767 aa  68.9  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  32.14 
 
 		 767 aa  67  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2197  alkylmercury lyase  31.38 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  30.23 
 
 		 745 aa  59.3  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0319  alkylmercury lyase  26.17 
 
 		 209 aa  48.5  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3948  hypothetical protein  32.47 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.187867 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0164  alkylmercury lyase  33.33 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.581292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4942  alkylmercury lyase  32.04 
 
 		 232 aa  46.6  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0286842  normal  0.02099 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5375  alkylmercury lyase  25.63 
 
 		 214 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>