17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_pSN254_0164 on replicon NC_009140
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009140  SNSL254_pSN254_0164  alkylmercury lyase  100 
 
 
212 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.581292  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02948  alkylmercury lyase  44.88 
 
 
211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.597593  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0243  alkylmercury lyase  42.23 
 
 
211 aa  154  6e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4512  alkylmercury lyase  42.23 
 
 
221 aa  151  8e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0148177 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3214  alkylmercury lyase  39.51 
 
 
213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00854121  normal  0.424714 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0319  alkylmercury lyase  40.21 
 
 
209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25630  alkylmercury lyase  42.31 
 
 
227 aa  137  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5374  Alkylmercury lyase  41.32 
 
 
216 aa  121  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2647  Alkylmercury lyase  39.23 
 
 
213 aa  97.1  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2330  alkylmercury lyase  32.04 
 
 
215 aa  92.4  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0726495  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2197  alkylmercury lyase  25.28 
 
 
317 aa  55.5  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  29.1 
 
 
767 aa  53.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4942  alkylmercury lyase  28.14 
 
 
232 aa  53.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0286842  normal  0.02099 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0322  hypothetical protein  40 
 
 
100 aa  52.8  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  28.87 
 
 
767 aa  52  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1789  alkylmercury lyase  28 
 
 
218 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.363956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4960  hypothetical protein  33.33 
 
 
226 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0619333  normal  0.992711 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>