17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4942 on replicon NC_008697
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008697  Noca_4942  alkylmercury lyase  100 
 
 		 232 aa  459  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0286842  normal  0.02099 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2330  alkylmercury lyase  26.86 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0726495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  33.86 
 
 		 767 aa  62.4  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0426  alkylmercury lyase  32.81 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0319  alkylmercury lyase  32.24 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4512  alkylmercury lyase  28.28 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0148177 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5374  Alkylmercury lyase  28.33 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3214  alkylmercury lyase  26.06 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00854121  normal  0.424714 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0164  alkylmercury lyase  28.14 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.581292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  31.97 
 
 		 767 aa  52.8  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25630  alkylmercury lyase  25.5 
 
 		 227 aa  49.3  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  30.77 
 
 		 745 aa  47  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02948  alkylmercury lyase  23.84 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.597593  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4960  hypothetical protein  32.04 
 
 		 226 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0619333  normal  0.992711 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2647  Alkylmercury lyase  27.19 
 
 		 213 aa  45.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0243  alkylmercury lyase  22.67 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1768  alkylmercury lyase  29.66 
 
 		 190 aa  43.9  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.628119  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>