16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5375 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5375  alkylmercury lyase  100 
 
 
214 aa  437  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2197  alkylmercury lyase  46.43 
 
 
317 aa  154  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  38 
 
 
767 aa  97.1  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  34.87 
 
 
767 aa  85.1  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  33.85 
 
 
745 aa  77  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3948  hypothetical protein  36.84 
 
 
193 aa  60.1  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.187867 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25630  alkylmercury lyase  30.34 
 
 
227 aa  56.6  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2556  hypothetical protein  40.66 
 
 
161 aa  55.8  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3214  alkylmercury lyase  30.87 
 
 
213 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00854121  normal  0.424714 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5374  Alkylmercury lyase  27.01 
 
 
216 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0426  alkylmercury lyase  28.12 
 
 
226 aa  48.9  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2324  organomercurial lyase  34.78 
 
 
181 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4512  alkylmercury lyase  29.55 
 
 
221 aa  45.1  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0148177 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4960  hypothetical protein  25.63 
 
 
226 aa  45.1  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0619333  normal  0.992711 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1789  alkylmercury lyase  28.14 
 
 
218 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.363956 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0243  alkylmercury lyase  29.77 
 
 
211 aa  42.4  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>